技术领域
本发明涉及蓝舌病毒检测技术领域,具体涉及一种蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型检测试剂盒及其检测方法。
背景技术
蓝舌病毒(Bluetongue virus)属于呼肠孤病毒科、环状病毒属,是一种以库蠓为主要传播媒介感染包括牛、绵羊、山羊、反刍动物等发生蓝舌病(Bluetongue,BT)的病原体。蓝舌病可引起发热、极度呼气困难、口腔溃疡、皮肤和黏膜出血性病灶和重度出血性腹泻等不同临床症状,同时还会引起怀孕的反刍动物流产或产下先天感染和畸形后代,感染动物的平均病死率高达30%。自19世纪在南非发现首例感染蓝舌病的细毛羊后,由于其具有非接触传染性,可以在一些国家或地区传播、流行,同时造成反刍动物的大批死亡,带来巨大的经济损失,对畜牧业的发展构成了严重的威胁,因而引起了世界卫生组织的高度重视,WHO也将该传染病列为动物A类传染病。
蓝舌病毒存在多个不同的血清型,迄今为止全世界已发现27个血清型,而我国已鉴定出其中12个血清型的蓝舌病毒,分别为BTV-1、2、3、4、5、7、9、12、15、16、21以及23型,其中BTV-1型和BTV-16型在自然感染发病的绵羊体内分离获得,是主要的致病血清型。由于蓝舌病毒具有多种血清型,各血清型之间不存在交叉免疫,且具有变异较快,传播迅速等特点。因此早期的检测和诊断,是有效预防和限制该病毒流行的关键。
目前,蓝舌病毒的检测和鉴定需要在库蠓细胞、反刍动物组织细胞或者鸡胚中培养接种,从中分离扩增病毒,再通过血清学方法检测。但此类方法存在步骤繁琐、耗时长、成本高等缺陷,同时血清学检测灵敏性和特异性稍差,容易出现交叉反应,导致出现假阳性结果。近年来,随着分子生物学的发展,分子检测技术也有了进一步的提升,分子技术也普遍应用于病毒检测和诊断。
BTV基因大小约为19kb,由10分子双链RNA(dsRNA)组成,可编码12种不同的蛋白,包括7种结构蛋白VP1-VP7和5种非结构蛋白NS1、NS2、NS3、NS3a和NS4。其中VP2是病毒的主要特异型抗原和血凝素蛋白,可与受体结合、参与血凝,引导宿主特异性免疫,参与病毒毒力和细胞吸附作用,同时决定着BTV的血清型。不同血清型病毒之间VP2氨基酸序列差异在22.7%到72.9之间,研究表明VP2基因可用于血清型的检测。VP2由基因组片段L2编码,长度约为3000bp,本发明中提供一种检测蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因片段特异引物及其检测方法,有利于实现蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型的快速、准确的检测和诊断,缩短检测时间,对蓝舌病毒的早期检测、诊断、预防和限制该病毒的流行具有重要的意义。
发明内容
本发明目的在于提供一种检测蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型的试剂盒和检测方法。通过利用蓝舌病毒1型和16型特异性引物PCR扩增其VP2基因片段,比对PCR产物条带大小,实现两种蓝舌病毒血清型的快速、准确检测。
为实现上述目标,所采用的技术方案如下:
一种蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型检测试剂盒,所述试剂盒含有蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因特异性扩增引物,引物序列及产物大小如下:
a、蓝舌病毒1型VP2基因的特异性扩增引物,上游引物:5’ ACAGGCACAGTCCACTTACG3’;下游引物:5’ CATCTCGCGTGCAATCTTGG 3’;扩增片段长度为:700 bp;
b、蓝舌病毒16型VP2基因的特异性扩增引物,上游引物:5’ ACTGACGGAGCCAGAGGAT3’;下游引物:5’ TGACGTGGTATCCGCTTTCC 3’;扩增片段长度为:367 bp;
c、如a或b所示的核苷酸序列经替换、删除或增加一个或多个碱基获得的核苷酸序列,且与a和b所示核苷酸序列功能相同或相似的核苷酸序列。
本发明还揭示了一种蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型的检测方法,包括如下步骤:
步骤1:合成上述蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因的引物组;
步骤2:制备阳性对照和阴性对照:阳性对照为分别携带有蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因的质粒,由生物公司合成;阴性对照为去离子水;
步骤3:制备待测样品:提取待测样品的RNA,经反转录为cDNA后进行PCR扩增;
步骤4:分别以上述cDNA、阴性对照和阳性对照为模板,配制PCR反应体系,即将步骤2,3中所得DNA溶液加入到PCR反应体系中,分别加入2种引物组进行PCR扩增;反应体系如下:
2×Es Taq MasterMix 12.5 μL;
引物p1(100 pmol/L) 0.5 μL;
引物p2(100 pmol/L) 0.5 μL;
模板DNA 2 μL;
加ddH
反应条件为:94℃预变性2 min,1个循环;94℃变性30 sec,61℃起第5个循环开始每个循环降低0.2℃退火30 sec ,72℃延伸30 sec,35个循环;72℃延伸10min,1个循环;最后12℃,保存;
步骤5:取出5-10 μL的PCR扩增产物,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,凝胶成像仪照相分析,与DNA Marker电泳条带进行比对判断出扩增条带的大小,将阳性对照与待测样品进行比对,即当样品中有蓝舌病毒1型存在时,在700 bp附近出现特异性条带,当样品中有蓝舌病毒16型存在时,在367 bp附近出现特异性条带。
采用上述技术方案的有益效果是:
1、此试剂盒采用分子技术的方法,对BTV-1型和BTV-16型蓝舌病毒VP2基因的快速检测,由于引物的特异性,可确保鉴定的准确性和可靠性;
2、此方法操作简单、快速,有效缩短了病毒检测时间,重复性好,适宜推广;
3、本发明直接提取待测样本RNA,经反转录为cDNA后进行PCR扩增,检测过程简单,检测成本低,具有更强的适用性。
附图说明
图1为本发明中BTV-1型和BTV-16型蓝舌病毒检测方法的技术流程图。
具体实施方式
一种蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型检测试剂盒,所述试剂盒含有蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因特异性扩增引物,引物序列及产物大小如下:
a、蓝舌病毒1型VP2基因的特异性扩增引物,上游引物:5’ ACAGGCACAGTCCACTTACG3’;下游引物:5’ CATCTCGCGTGCAATCTTGG 3’;扩增片段长度为:700 bp;
b、蓝舌病毒16型VP2基因的特异性扩增引物,上游引物:5’ ACTGACGGAGCCAGAGGAT3’;下游引物:5’ TGACGTGGTATCCGCTTTCC 3’;扩增片段长度为:367 bp;
c、如a或b所示的核苷酸序列经替换、删除或增加一个或多个碱基获得的核苷酸序列,且与a和b所示核苷酸序列功能相同或相似的核苷酸序列。
本发明还揭示了一种蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型的检测方法,包括如下步骤:
步骤1:合成上述蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因的引物组;
步骤2:制备阳性对照和阴性对照:阳性对照为分别携带有蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型VP2基因的质粒,由生物公司合成;阴性对照为去离子水;
步骤3:制备待测样品:提取待测样品的RNA,经反转录为cDNA后进行PCR扩增;
步骤4:分别以上述cDNA、阴性对照和阳性对照为模板,配制PCR反应体系,即将步骤2,3中所得DNA溶液加入到PCR反应体系中,分别加入2种引物组进行PCR扩增;反应体系如下:
2×Es Taq MasterMix 12.5 μL;
引物p1(100 pmol/L) 0.5 μL;
引物p2(100 pmol/L) 0.5 μL;
模板DNA 2 μL;
加ddH2O至25 μL;
反应条件为:94℃预变性2 min,1个循环;94℃变性30 sec,61℃起第5个循环开始每个循环降低0.2℃退火30 sec ,72℃延伸30 sec,35个循环;72℃延伸10min,1个循环;最后12℃,保存;
步骤5:取出5-10 μL的PCR扩增产物,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,凝胶成像仪照相分析,与DNA Marker电泳条带进行比对判断出扩增条带的大小,将阳性对照与待测样品进行比对,即当样品中有蓝舌病毒1型存在时,在700 bp附近出现特异性条带,当样品中有蓝舌病毒16型存在时,在367 bp附近出现特异性条带。
1、样品中RNA的提取
将待测组织或细胞用RNAsimple RNA Kit试剂盒按照其操作说明提取基因组RNA,该RNA提取试剂盒可购自天根生化科技有限公司或其他生物公司。提取的RNA需立即进行反转录扩增或置于-80℃冰箱保存备用。
2、cDNA的合成
在Eppendorf管中加入8 µL上述RNA以及2 µL 5×RT Master Mix,进行反转录,反转录条件为:37℃ 25min、50℃ 5min、98℃ 5min、4℃保存。序列表
<110> 遵义医科大学
<120> 蓝舌病毒1型和蓝舌病毒16型检测试剂盒及其检测方法
<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 蓝舌病毒(Bluetongue virus)
<400> 1
acaggcacag tccacttacg 20
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tgacgtggta tccgctttcc 20。
序列表
<110> 遵义医科大学
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<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
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<212> DNA
<213> 蓝舌病毒(Bluetongue virus)
<400> 1
acaggcacag tccacttacg 20
<210> 2
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<212> DNA
<213> 蓝舌病毒(Bluetongue virus)
<400> 2
catctcgcgt gcaatcttgg 20
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<213> 蓝舌病毒(Bluetongue virus)
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<213> 蓝舌病毒(Bluetongue virus)
<400> 4
tgacgtggta tccgctttcc 20
机译: 血清型8的蓝舌病病毒的VP2衣壳蛋白,具有该蛋白的组合物或化合物在制备试剂或试剂盒中的用途,所述试剂或试剂盒用于体外诊断动物中BTV病毒的感染。牛的
机译: 灭活的多效价疫苗,用于治疗蓝蛋白舌(含1,2,23型蓝舌病毒)
机译: 包含重组痘病毒的免疫原性组合物,向动物施用的试剂盒,在动物中诱导针对蓝舌病毒的免疫应答的方法以及包括向动物施用该免疫原性组合物的鉴别诊断方法