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一种检测样本中目标序列整合和突变的方法及其引物的设计方法和试剂盒

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本发明实施例提供了一种检测样本中目标序列整合和突变的方法及其引物的设计方法和试剂盒，涉及基因工程和分子生物学领域，本发明通过以目标序列为模板设计多组背靠背引物，并将多组所述背靠背引物分为两个或两个以上的引物池，使得每个引物池中相邻两组背靠背引物对应的目标区域之间的间隔距离≥所述引物池的个数ⅹ(45～75)；基于上述引物设计原则设计的引物对添加有环化接头的cfDNA片段进行环化扩增，能够同时对目标序列的整合和突变进行高特异性的检测，为基因整合和基因突变的检测方法提供了新的思路。

著录项

公开/公告号CN113549674A

专利类型发明专利
公开/公告日2021-10-26

原文格式PDF
申请/专利权人福建和瑞基因科技有限公司;
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申请/专利号CN202110829551.9
发明设计人茹兰兰;刘高京;王寅;白健;苏晓星;吴琳;
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申请日2021-07-22
分类号C12Q1/6806(20180101);C12Q1/70(20060101);G16B30/00(20190101);G16B25/20(20190101);G16B20/50(20190101);C12R1/93(20060101);
代理机构11463 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙);
代理人安卫静
地址 350000 福建省福州市长乐市数字福建产业园东湖路33号7号研发楼
入库时间 2023-06-19 13:00:48

法律信息

法律状态公告日

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法律状态
2023-11-03

授权

发明专利权授予

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1. 一种检测样本中目标序列整合和突变的方法及其引物的设计方法和试剂盒 [P] . 中国专利： CN113549674A . 2021-10-26
2. 引物的设计方法、目标核酸的检测方法、单碱基突变的检测方法以及检测试剂盒 [P] . 中国专利： CN101003836A . 2007-07-25
3. method for specifically detecting the presence or absence of one or more single nucleotide mutations in one or more hiv-1 genes or proteins, method for detecting the presence or absence of mutations, selective oligonucleotide primer, oligonucleotide, kit for detecting a mutation , oligonucleotide blending for selective mutation detection and simultaneous detection of two or more mutations in one or more hiv-1 proteins [P] . BR112015029785A2 . 2017-09-26

机译：用于特异性地检测一种或多种hiv-1基因或蛋白质中一种或多种单核苷酸突变的存在或不存在的方法，用于检测突变的存在或不存在的方法，选择性寡核苷酸引物，寡核苷酸，用于检测突变的试剂盒，寡核苷酸掺合用于选择性突变检测并同时检测一种或多种hiv-1蛋白中的两个或多个突变
4. Processes for detecting a mutation in the nucleic acid to detect fungal and fungal resistance to an analogue of estobilurina,Fungal DNA sequence encoding all or part of a proteu00ecna of cytochrome b, cytochrome b proteu00ecna fungal.The allele specific oligonucleotu00ecdeo capable of connecting to a sequence of fungal nucleic acid, initiator of diagnosis or diagnostic oligonucleotu00ecdeo capable of connecting to a template.One or more diagnostic primers, probe the allele specific oligonucleotu00ecdeo, diagnostic kit to detect fungal pathogen resistance, process plant, a fungicide.To detect and quantify the frequency of mutation, to select a fungicide active and their nu00ecveis optimal implementation, and to control the fungal infection of a collection, and,A computer legu00ecvel [P] . BR0010163A . 2002-01-15

机译：用于检测核酸突变的方法，以检测对食管胆囊炎类似物的真菌和真菌抗性，真菌DNA序列编码全部或部分细胞色素b蛋白，细胞色素b蛋白真菌，等位基因特异性寡核苷酸能够连接到真菌核酸序列的诊断或诊断寡核苷酸的启动子，能够连接到模板。一个或多个诊断引物，探查等位基因特异性寡核苷酸，诊断试剂盒以检测真菌病原体抗性，加工厂要检测和量化突变的频率，选择一种活性杀菌剂及其最佳实施方案，控制一个集合体的真菌感染以及计算机支路，
5. Control primer annealing to improve the specificity of annealing in nucleic acid amplification kit.Methods for amplifying a nucleic acid sequence of a DNA or a mixture of nucleic acids.And for selectively amplifying a nucleic acid sequence of a target DNA or a mixture of nucleic acids, and a sequence of the target nucleic acid from a mRNA.Method for detecting the complementarity of DNA to mRNA differentially expressed in two or more samples of nucleic acid, methods for amplifying a fragment of the cDNA and DNA quickly target.And to amplify a population of cDNAs of filament double full-length complementary to mRNAs cDNAs, and filament double fortified with 5 'complementary to mRNAs,Method to amplify rather than a sequence of nucleotu00ecdeo target at the same time, methods for producing a digital printing gDNA DNA, and RNA in a sample of mRNA.Method for identifying segments of homology is conserved in a family of multigene from a sample of mRNA, a method for the mutagenesis in a target [P] . BR0214741A . 2004-11-23

机译：控制引物退火，以提高核酸扩增试剂盒中退火的特异性。扩增DNA或核酸混合物的核酸序列的方法以及选择性扩增靶DNA或核酸混合物的核酸序列的方法用于检测DNA与两个或多个核酸样品中差异表达的mRNA的互补性的方法，扩增cDNA和DNA片段的方法可快速靶向。全长与mRNA cDNA互补的双细丝cDNA的cDNA群体，以及与mRNA互补的5'增强双细丝的cDNA，同时扩增而不是核苷酸靶序列的方法，产生数字印刷gDNA DNA的方法mRNA样品中的RNA和RNA.mRNA样品的多基因家族中用于鉴定同源片段的方法是保守的，这是一种在靶标中诱变的方法