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一种与小鼠空间学习记忆能力相关的基因

摘要

本发明公开了一种与小鼠空间学习记忆能力相关的基因,属于生物医药技术领域。本发明利用高通量测序技术对C57BL/6与DBA/2小鼠的海马组织进行转录组测序分析,筛选与两种小鼠空间学习记忆能力相关的重要遗传信息,为寻找新的用于评价空间学习记忆功能的分子生物学标记和发现新的针对与学习记忆的药物靶点提供分子生物学依据。

著录项

  • 公开/公告号CN113846170A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-12-28

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南通大学;

    申请/专利号CN202111098542.3

  • 申请日2021-09-18

  • 分类号C12Q1/6888(20180101);

  • 代理机构32200 南京经纬专利商标代理有限公司;

  • 代理人黄欣

  • 地址 226019 江苏省南通市崇川区啬园路9号

  • 入库时间 2023-06-19 13:27:45

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-01-24

    发明专利申请公布后的撤回 IPC(主分类):C12Q 1/6888 专利申请号:2021110985423 申请公布日:20211228

    发明专利申请公布后的撤回

说明书

技术领域

本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一种与小鼠空间学习记忆能力相关的基因。

背景技术

学习记忆是大脑最高级的功能之一,涉及到大量的分子与复杂过程。由于伦理方面的考虑,在人上面关于学习记忆的研究仅能利用功能性核磁共振成像(fMRI)、功能近红外光谱(fNIRS)、事件相关电位(ERPs)等非侵入性的设备,无法进行更深层次的分子生物机制研究。已有人类的fMRI实验与早期的动物实验都显示了海马组织在学习记忆中至关重要。

鉴于小鼠在生理、解剖和代谢方面与人类的相似性及其遗传易处理性,小鼠已成为许多领域的卓越模式生物,其中包括学习记忆的研究。C57BL/6与DBA/2小鼠是神经科学领域上应用最广泛的两个近交系品种,已有大量研究证明C57BL/6小鼠在一系列依赖于海马组织的空间学习记忆方面的表现都要显著优于DBA/2小鼠,如:Morris水迷宫、巴恩斯迷宫、Y迷宫、恐惧条件反射等。已鉴别到的两种小鼠在行为与遗传上的差异对于神经科学研究非常重要,也表明海马组织的不同表达模式可能解释了两种小鼠在空间学习记忆能力上的差异。虽然已有大量研究着力于鉴别与学习记忆能力相关的候选基因,像BDNF、CREB、NCAM等基因也在文献中报道与学习记忆能力有关,但空间学习记忆的具体机制未被探究清楚。海马组织内更多与空间学习记忆相关的遗传标记仍需要进一步被挖掘。

发明内容

本发明的目的是提供Calb2基因在评价空间学习记忆功能或筛选学习记忆的药物中的应用。

本发明利用高通量测序技术对C57BL/6与DBA/2小鼠的海马组织进行转录组测序分析,筛选与两种小鼠空间学习记忆能力相关的重要遗传信息,为寻找新的用于评价空间学习记忆功能的分子生物学标记和发现新的针对与学习记忆的药物靶点提供分子生物学依据。

本发明通过研究显示,Calb2基因在C57BL/6与DBA/2小鼠海马组织的表达水平存在显著差异,在C57BL/6小鼠海马组织的平均表达水平为40.17,在DBA/2小鼠海马组织的平均表达水平为22.78,差异表达倍数为1.76倍,Morris水迷宫是衡量啮齿类动物空间学习记忆的重要方法,经过30天的水迷宫训练后,与前10天相比,DBA/2的潜伏期显著缩短,说明其空间学习记忆功能显著提升,同时Calb2基因的平均表达水平也上升为28.75,是未训练DBA/2小鼠的1.26倍。说明Calb2基因与小鼠的学习记忆功能存在明显相关性,可作为评价空间学习记忆功能的分子生物学标记,也可以为与学习记忆的药物靶点提供分子生物学依据。

附图说明

图1为Calb2基因在C57BL/6与DBA/2小鼠海马组织的表达差异结果(n=3)。

图2为Morris水迷宫训练后DBA/2小鼠空间学习记忆能力的变化结果(n=10)。

图3为 Calb2基因在训练与未训练DBA/2小鼠海马组织的表达差异结果(n=3)。

具体实施方式

下面结合具体实施例对本发明做进一步说明。下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到,未详细描述的技术均按照本领域人员熟知的标准方法进行。

本发明所述Calb2基因的mRNA序列如SEQ ID NO.1所示。具体如下:

GCGAGAACCAGAGCCAAGCGGCACCGAGTGACAGCGCGCTGAGAGAGAGGCTTAAGATCTCCGGAGCGGCTCGCCATGGCTGGCCCGCAGCAGCAGCCCCCTTACCTGCACCTGGCCGAGCTGACTGCATCCCAGTTCCTGGAAATCTGGAAGCACTTTGATGCTGACGGAAATGGGTACATTGAAGGTAAAGAGCTAGAGAACTTCTTCCAGGAGCTGGAGAAGGCAAGGAAGGGTTCTGGCATGATGTCCAAGAGCGACAATTTTGGAGAGAAGATGAAGGAGTTCATGCAGAAGTATGATAAGAACTCAGATGGGAAAATTGAGATGGCGGAGCTGGCGCAGATCCTGCCGACCGAAGAGAATTTCCTTTTGTGCTTCAGGCAGCACGTGGGCTCCAGCGCTGAGTTTATGGAGGCTTGGCGGAAGTATGACACAGACAGAAGTGGCTACATCGAAGCCAATGAGCTCAAGGGATTCCTGTCTGACCTCCTGAAGAAGGCCAACAGGCCCTATGATGAACCTAAGCTCCAGGAGTACACCCAGACCATACTACGGATGTTTGACTTAAATGGAGATGGCAAATTGGGTCTCTCAGAGATGTCTAGACTCTTGCCTGTACAAGAGAACTTCCTGCTGAAATTTCAGGGTATGAAGCTGACCTCAGAAGAGTTCAATGCCATCTTCACATTTTATGACAAGGATGGAAGCGGCTATATTGATGAGAATGAACTGGACGCCCTCCTGAAGGATCTGTATGAGAAGAACAAGAAGATGAACATCCAACAGCTCACCACCTACAGGAAGAGTGTCATGTCCTTGGCCGAGGCAGGGAAGCTCTACAGAAAGGACCTGGAGATTGTGCTCTGCAGTGAGCCCCCCGTGTAAAGGGGTGAAGGGACAGGGGCTGCTTCTGCGCCTCCCTTGAACCCCGCCCCCGCTGTCCTGACTCTCTTGACACTCCTTCCCAGACCTCCCCACCCCCTGCCACCTGCACACACCAGCCTGTGGATCTGGAAAGGAGAGATGGAGAGAGGGTGGCTGGTAGGGTTCCTTAGGCCTGATAGACAGTTGTGCCTGCGTTGGGTCACGGTTGGTGGGCGGGGCTGCAGGGGAAGCTTCTGTCGTCTCCGCTGCGATGCATGAGTTCCTTCGCTGTATGATTTAGGCTTCTGAGTCCCACAGAGTGGACTCCTTCCTCTTGCTGCGCCACCCCTCCCCCTTTCTCCCCGGTCCACCGCTGACCCCGGACTTCCAGGTTCTGCCCACCAGCTTGCTTAATGATCTAGCTGTCTTCTCAGAGCTACTGTGGAGGGTGACTGCCCTCTCCTTGTGTTCTTGACGTGTGTGTTCCTTTTCTCTTTGGCTTCCCCTGTCTTCTTGTTTACCAAAGAAGAGTTTACAGAGAATAAAGTGGAAATGTTCTGTCGCGGACACTCACCCGTT

实施例1

本发明通过下述实验,证明发明的Calb2基因与小鼠空间学习记忆能力的相关性。

1、C57BL/6与DBA/2小鼠海马组织差异表达基因的筛选

采用的实验动物为4周龄C57BL/6与DBA/2各10只,雄性,适应性饲养30天,然后麻醉状态下处死C57BL/6与DBA/2小鼠,分离海马组织,各合并成3个样品,提取总RNA样品,利用转录组测序技术,构建两组小鼠海马组织的基因表达谱,利用FPKM 的方法统计基因表达水平,筛选两组小鼠海马组织差异表达基因的标准为:表达变异倍数在1.2倍以上,校正后的P值小于0.05。

2、Morris水迷宫训练对DBA/2小鼠海马组织基因表达的影响

采用的实验动物为4周龄DBA/2小鼠20只,雄性,适应性饲养7天,随机分为对照组与训练组,训练组进行为期30天的Morris水迷宫训练,每天2次,记录每只小鼠的潜伏期,训练组小鼠潜伏期的前后比较采用重复测量方差分析LSD 法进行两两比较,当

如图1所示,Calb2基因在C57BL/6小鼠海马内的表达量极显著(foldchagne>1.2,P

如图2所示,与训练前10天的潜伏期相比,训练中间10天的潜伏期显著降低(P<0.05),后10天的潜伏期显著低于前10天与中间10天的潜伏期(P<0.05),说明经过30天的Morris水迷宫训练,DBA/2小鼠的空间学习记忆能力得到了显著提升。

如图3所示,与未训练的对照组DBA/2小鼠比较,训练后空间学习记忆能力提升的DBA/2小鼠海马组织内Calb2基因的表达量也显著升高(foldchagne>1.2, Padj<0.001),表明Calb2基因的表达量与小鼠的空间学习记忆能力相关。

序列表

<110> 南通大学

<120> 一种与小鼠空间学习记忆能力相关的基因

<160> 1

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 1446

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 1

gcgagaacca gagccaagcg gcaccgagtg acagcgcgct gagagagagg cttaagatct 60

ccggagcggc tcgccatggc tggcccgcag cagcagcccc cttacctgca cctggccgag 120

ctgactgcat cccagttcct ggaaatctgg aagcactttg atgctgacgg aaatgggtac 180

attgaaggta aagagctaga gaacttcttc caggagctgg agaaggcaag gaagggttct 240

ggcatgatgt ccaagagcga caattttgga gagaagatga aggagttcat gcagaagtat 300

gataagaact cagatgggaa aattgagatg gcggagctgg cgcagatcct gccgaccgaa 360

gagaatttcc ttttgtgctt caggcagcac gtgggctcca gcgctgagtt tatggaggct 420

tggcggaagt atgacacaga cagaagtggc tacatcgaag ccaatgagct caagggattc 480

ctgtctgacc tcctgaagaa ggccaacagg ccctatgatg aacctaagct ccaggagtac 540

acccagacca tactacggat gtttgactta aatggagatg gcaaattggg tctctcagag 600

atgtctagac tcttgcctgt acaagagaac ttcctgctga aatttcaggg tatgaagctg 660

acctcagaag agttcaatgc catcttcaca ttttatgaca aggatggaag cggctatatt 720

gatgagaatg aactggacgc cctcctgaag gatctgtatg agaagaacaa gaagatgaac 780

atccaacagc tcaccaccta caggaagagt gtcatgtcct tggccgaggc agggaagctc 840

tacagaaagg acctggagat tgtgctctgc agtgagcccc ccgtgtaaag gggtgaaggg 900

acaggggctg cttctgcgcc tcccttgaac cccgcccccg ctgtcctgac tctcttgaca 960

ctccttccca gacctcccca ccccctgcca cctgcacaca ccagcctgtg gatctggaaa 1020

ggagagatgg agagagggtg gctggtaggg ttccttaggc ctgatagaca gttgtgcctg 1080

cgttgggtca cggttggtgg gcggggctgc aggggaagct tctgtcgtct ccgctgcgat 1140

gcatgagttc cttcgctgta tgatttaggc ttctgagtcc cacagagtgg actccttcct 1200

cttgctgcgc cacccctccc cctttctccc cggtccaccg ctgaccccgg acttccaggt 1260

tctgcccacc agcttgctta atgatctagc tgtcttctca gagctactgt ggagggtgac 1320

tgccctctcc ttgtgttctt gacgtgtgtg ttccttttct ctttggcttc ccctgtcttc 1380

ttgtttacca aagaagagtt tacagagaat aaagtggaaa tgttctgtcg cggacactca 1440

cccgtt 1446

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