本发明提供了分子标记21W2及其用于筛选具有高繁殖力的凡纳滨对虾群体中的应用。所述分子标记21W2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其中第301位碱基G在凡纳滨对虾高繁殖力群体中的等位基因频率≥63.33%。本发明还提供了所述的分子标记21W2的引物，包括核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的扩增引物以及核苷酸序列如SEQ ID No.4所示的延伸引物。凡纳滨对虾高繁殖力分子标记21W2可以不受生长阶段的限制，能够用于凡纳滨对虾早期选育，快速选育出繁殖性状优良的亲本群体，促进凡纳滨对虾高繁殖力新品种的选育进程。
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