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基于二代测序数据检测MHC II型肿瘤新生抗原的方法和装置

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本申请公开了一种基于二代测序数据检测MHC II型肿瘤新生抗原的方法和装置。本申请方法包括，分别获取肿瘤样本DNA和RNA测序数据，比对到人全基因组参考序列，分析鉴定肿瘤样本HLA分型，发生变异的基因，并将发生变异的基因翻译为氨基酸序列，将其作为候选集，分析各基因表达量值TPM，最后，根据HLA分型和MHC II型肿瘤新生抗原预测模型，从候选集中筛选表达量值TPM大于TPM阈值的氨基酸序列，作为MHC II型肿瘤新生抗原。本申请方法，直接通过二代测序数据预测MHC II型肿瘤新生抗原，解决了肿瘤免疫治疗中对II型新生抗原预测和筛选的迫切需求，为肿瘤免疫研究和针对新生抗原的免疫治疗提供了帮助。

著录项

公开/公告号CN114882951A

专利类型发明专利
公开/公告日2022-08-09

原文格式PDF
申请/专利权人深圳裕泰抗原科技有限公司;
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申请/专利号CN202210592146.4
发明设计人但旭;王佳茜;
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申请日2022-05-27
分类号G16B30/10;G16B20/50;G16B20/20;C12Q1/6886;C12Q1/6869;
代理机构深圳鼎合诚知识产权代理有限公司;
代理人李小焦;彭家恩
地址 518000 广东省深圳市大鹏新区葵涌街道金业大道140号生命科学产业园A28栋2楼201室
入库时间 2023-06-19 16:30:07

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2022-08-26

实质审查的生效 IPC(主分类):G16B30/10 专利申请号:2022105921464 申请日:20220527

实质审查的生效

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