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一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法

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本发明公开了一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法，步骤如下：S1、数据预处理和特征提取；S2、确定标签；S3、模型的构建与评估，对步骤S2中的正负样本数据集采用机器学习、深度学习方法进行模型构建并对剩余的经过实验验证的50％的互作对和50％的不互作对采用评估指标进行评估；S4、模型的调优；S5、取m株保加利亚乳杆菌和n株嗜热链球菌的代谢通路图特征矩阵，通过对特征矩阵中相同的酶取交集并相加得到融合特征向量，通过降维方法对融合特征向量降维，重复S2到S4。S6、取S4和S5中评估结果较优的模型。本发明采用上述一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法，采用特征提取、聚类、机器学习与深度学习技术，加快了检测速度。

著录项

公开/公告号CN114999586A

专利类型发明专利
公开/公告日2022-09-02

原文格式PDF
申请/专利权人内蒙古农业大学;
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申请/专利号CN202210671757.8
发明设计人孙志宏;董改芳;赵洁;白梅;
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申请日2022-06-14
分类号G16C20/30;G06N20/00;G06N3/04;G06K9/62;
代理机构北京圣州专利代理事务所(普通合伙);
代理人李春
地址 010018 内蒙古自治区呼和浩特市鄂尔多斯大街内蒙古农业大学新校区
入库时间 2023-06-19 16:39:50

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法律状态公告日

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法律状态
2022-09-02

公开

发明专利申请公布

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