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采用De novo转录组分析鉴定隐甲藻中与DHA生物合成相关的脂肪酸去饱和酶基因的方法

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摘要

本发明公开了一种通过De novo转录组测序，转录本拼接和差异表达分析，鉴定蔻氏隐甲藻中与二十二碳六烯酸(DHA)生物合成相关脂肪酸去饱和酶基因的方法。具体步骤包括：(1)对隐甲藻进行DHA发酵培养；(2)收集不同生长和DHA积累阶段的菌体并进行RNA提取与转录组Illumina深度测序；(3)测序数据的分析与预处理；(4)对拼接后的转录组进行功能注释与相关性统计分析，鉴定发现隐甲藻中与DHA生物合成相关的脂肪酸去饱和酶，并获得其基因全长序列；(5)通过qRT‑PCR分析技术，对隐甲藻中与DHA生物合成相关的脂肪酸去饱和酶的基因进行表达验证。发明为研究隐甲藻DHA的生物合成机制以及提高隐甲藻中DHA合能力成提供重要的方法和知识基础。

著录项

公开/公告号CN106916891B

专利类型发明专利
公开/公告日2020-10-30

原文格式PDF
申请/专利权人昆明藻能生物科技有限公司;
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申请/专利号CN201710105914.8
发明设计人张卫文;陈磊;裴广胜;刘璐;
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申请日2017-02-24
分类号C12Q1/6895(20180101);C40B50/06(20060101);G16B20/00(20190101);G16B20/30(20190101);G16B25/20(20190101);
代理机构53115 昆明今威专利商标代理有限公司;
代理人赛晓刚
地址 650108 云南省昆明市科发路139号云南省大学科技园云南留学人员创业园二期A3栋5楼505-3号
入库时间 2022-08-23 11:19:11

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1. 采用De novo转录组分析鉴定隐甲藻中与DHA生物合成相关的脂肪酸去饱和酶基因的方法 [P] . 中国专利： CN106916891B . 2020.10.30
2. 采用De novo转录组分析鉴定隐甲藻中与DHA生物合成相关的脂肪酸去饱和酶基因的方法 [P] . 中国专利： CN106916891A . 2017-07-04
3. Nucleotide sequences of the mutant and non-mutant fragments of loci A and C of alleles of double low (00) fad3 form desaturase gene and low-linolenic mutant (LLMut) of oilseed rape plants (Brassica napus L. var. Oleifera), allospecific SNP markers specific for loci A and C of fad3 form desaturase gene - double low (00) and low-linolenic mutant (LLMut) of winter oilseed rape plants, nucleotide sequences of primer pairs for the amplification of loci A and C of fad3 form desaturase gene of winter oilseed rape plants, method for amplification of loci A and C of fad3 desaturase gene of winter oilseed rape plants, nucleotide sequences of the primers for the identification of mutant and non-mutant alleles of fad3 forms desaturase gene - double low (00) and low-linolenic mutant (LLMut) of oilseed rape in locus A and locus C in the microsequencing reaction, method for the identification of mutant and non-mutant alleles of fad3 form desaturase gene - double low (00) and low-linolenic mutant (LLM [P] . PL211126B1 . 2012-04-30

机译：双低（00）fad3等位基因的等位基因双低等位基因（A）的位点A和C的突变和非突变片段的核苷酸序列形成去饱和酶基因和油菜植物（甘蓝型油菜）的低亚麻酸突变体（LLMut），是同种异体对fad3基因座A和C特异的SNP标记形成去饱和酶基因-冬季油菜植物的双低（00）和低亚麻酸突变体（LLMut），用于扩增fad3基因去饱和酶A和C的引物对的核苷酸序列冬季油菜植物基因，fad3去饱和酶基因的基因座A和C的扩增方法，用于鉴定fad3形式脱氢酶基因的突变和非突变等位基因的引物的核苷酸序列-双低（00 ）和基因座A和基因座C中油菜的低亚麻酸突变体（LLMut）的微测序反应，fad3形式脱氢酶基因突变和非突变等位基因的鉴定方法-双低（00）和低亚麻酸突变体（法学硕士
4. Method for producing polyunsaturated fatty acids in transgenic organisms to contain at least a delta-9 elongase and desaturase Delta - 8 - and if necessary alsoA Delta - desaturase; nucleotide sequences of delta - desaturase - 8 [P] . CL2003002667A1 . 2005-04-08

机译：在转基因生物中产生多不饱和脂肪酸的方法，所述多不饱和脂肪酸至少包含Δ9延伸酶和去饱和酶Δ8-，必要时还包含Δ-去饱和酶; δ-去饱和酶-8的核苷酸序列
5. Polynucleotides that control delta-6-desaturase genes and methods for identifying compounds for modulating delta-6-desaturase [P] . AU4400201A . 2001-10-03

机译：控制delta-6去饱和酶基因的多核苷酸及鉴定调节delta-6去饱和酶的化合物的方法