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基于模糊谱聚类的不确定PPI网络功能模块挖掘方法

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本公开提供一种基于模糊谱聚类的不确定PPI网络功能模块挖掘方法包括以下步骤：去掉蛋白质相互作用数据中的重复相互作用和自相互作用，利用边聚集系数来测度每一组相互作用，构建不确定蛋白质相互作用网络图；利用流行距离和蛋白质网络的拓扑特性来改进谱聚类算法的相似度度量，进一步采用谱聚类算法完成对蛋白质相互作用数据的预处理；采用DPCS策略选取初始聚类中心，基于初始聚类中心，采用模糊C‑均值算法不断更新聚类中心和隶属度，进而实现蛋白质相互作用功能模块的挖掘；利用期望稠密度融合边聚集系数的边期望稠密度来过滤挖掘出的蛋白质相互作用功能模块；以及输出预测挖掘出的蛋白质相互作用功能模块。

著录项

公开/公告号CN109545275B

专利类型发明专利
公开/公告日2020-11-10

原文格式PDF
申请/专利权人江西理工大学;
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申请/专利号CN201811149953.9
发明设计人毛伊敏;刘银萍;毛丁慧;
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申请日2018-09-29
分类号G16B15/00(20190101);
代理机构11551 北京鼎承知识产权代理有限公司;
代理人李伟波;韩德凯
地址 341000 江西省赣州市章贡区红旗大道86号
入库时间 2022-08-23 11:20:51

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