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利用转录组测序的SSR分子标记鉴定火龙果种质的方法

摘要

本发明公开了一种利用转录组测序的SSR分子标记鉴定火龙果种质的方法,该方法设计序列表所示的EST‑SSR标记引物并包括以下步骤:S1,取火龙果幼嫩茎尖,用于提取基因组DNA;S2,基于火龙果转录组测序的序列设计SSR引物,并进行PCR扩增体系优化;S3,PCR采用10μl反应体系:包含10‑50ng模板DNA 1‑2μl,正、反向引物各0.2‑0.5μl,5μl Mix及适量ddH2O;S4,PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃反应30s,54‑63℃反应30s,72℃反应30s,进行35个循环;72℃延伸8min;4℃最终保存;S5,PCR扩增产物先进行引物初步筛选,然后再进行多态性筛选,根据谱带的有无和大小来判定结果。本发明需要解决的关键技术是EST‑SSR标记引物的获得和筛选,以及PCR扩增体系的优化。

著录项

  • 公开/公告号CN107190097B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-04-30

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 贵州大学;

    申请/专利号CN201710620537.1

  • 发明设计人 文晓鹏;杨仕美;乔光;

    申请日2017-07-26

  • 分类号C12Q1/6895(20180101);C12Q1/6858(20180101);

  • 代理机构52100 贵阳中新专利商标事务所;

  • 代理人李余江;程新敏

  • 地址 550025 贵州省贵阳市花溪区贵州大学北校区科学技术处

  • 入库时间 2022-08-23 11:43:29

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