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一种基于不确定图模型侦测蛋白质复合物的方法

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本发明提出一种基于不确定图模型侦测蛋白质复合物的方法，该方法包括：将蛋白质作为不确定图的顶点，蛋白质之间的相互作用作为不确定图的边；根据不确定图模型，定义期望稠密度，判断每个顶点是否属于核；计算蛋白质和他邻居蛋白质的皮尔逊系数，进一步判断该蛋白质是否属于核；根据不确定图模型，定义邻居顶点相关度，判断该蛋白质是否属于附件；对所有挖掘到的蛋白质复合物进行冗余过滤。本发明所采用的不确定图模型具有很好的表示动态PPI网络，更切合实际，从而加快了搜索效率，更能精确预言蛋白质复合物。

著录项

公开/公告号CN109493915B

专利类型发明专利
公开/公告日2021-05-07

原文格式PDF
申请/专利权人桂林电子科技大学;
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申请/专利号CN201811518891.4
发明设计人徐周波;黄文文;刘华东;常亮;杨健;
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申请日2018-12-12
分类号G16B5/00(20190101);G16B20/00(20190101);G16B45/00(20190101);
代理机构11429 北京中济纬天专利代理有限公司;
代理人石燕妮
地址 541004 广西壮族自治区桂林市七星区金鸡路1号
入库时间 2022-08-23 11:45:29

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