首页> 中国专利> 面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统

面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统

页面导航

摘要
著录项
相似文献

摘要

本发明提供一种面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统，所述方法包括：依据分子动力学模拟程序中每个MPI进程上所模拟的空间大小初始化hash表，利用初始化后的hash表存储分子动力学模拟程序中的粒子信息；使用偏移列表预先存储邻居晶格点的偏移量；在分子动力学模拟程序的每一个时间步循环中，对于每一个粒子，使用所述偏移列表遍历其邻居粒子，以计算邻居粒子对当前粒子的作用力。本发明的面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法可以大大节省存储空间，邻居粒子索引速度更加高效，从而可以突破1012原子模拟规模。

著录项

公开/公告号CN111125892B

专利类型发明专利
公开/公告日2021-10-12

原文格式PDF
申请/专利权人北京科技大学;
展开▼

申请/专利号CN201911275994.7
发明设计人储根深;白鹤;陈丹丹;贺新福;杨文;胡长军;
展开▼

申请日2019-12-12
分类号G06F30/20(20200101);G06F119/14(20200101);
代理机构11237 北京市广友专利事务所有限责任公司;
代理人张仲波
地址 100083 北京市海淀区学院路30号
入库时间 2022-08-23 12:36:23

相似文献

专利
中文文献
外文文献

1. 面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统 [P] . 中国专利： CN111125892B . 2021.10.12
2. 面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统 [P] . 中国专利： CN111125892A . 2020-05-08
3. Object-oriented data storage and retrieval system using index table [P] . 美国专利： US6857000B2 . 2005-02-15

机译：使用索引表的面向对象的数据存储和检索系统
4. Object-oriented data storage and retrieval system using index table [P] . 美国专利： US2003088576A1 . 2003-05-08

机译：使用索引表的面向对象的数据存储和检索系统
5. Object-oriented data storage and retrieval system using index table [P] . 美国专利： US6539388B1 . 2003-03-25

机译：使用索引表的面向对象的数据存储和检索系统