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一种根据基元反应拓扑结构构建动态代谢网络的方法

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本发明公开了一种动态代谢网络构建方法，其包括步骤(a)对于欲构建的动态代谢网络，找出所有的孤立反应和调控反应，确定每一个孤立反应中冗余的基元反应速率常数数目；(b)通过体外实验测定或从现有的酶学数据库获得所有孤立反应和调控反应的米氏动力学参数；(c/d)每一个孤立反应和调控反应中，计算出所有其余的基元反应速率常数的绝对值和/或相对值；(e)利用步骤(c)和(d)获得的基元反应速率常数，通过计算机构建基元反应拓扑结构型动态代谢网络。本发明方法无需逐一推导米氏动力学类速率方程解析式，在有热力学平衡常数的前提下，获得调控反应所涉及的基元反应速率常数比较简单，适合于计算机构建大型代谢网络。

著录项

公开/公告号CN108021787B

专利类型发明专利
公开/公告日2021-10-15

原文格式PDF
申请/专利权人华东理工大学;
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申请/专利号CN201711294057.7
发明设计人赵阔;潘天宇;魏冰洁;陈楚赟;仇隽;张丽梅;关岳;
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申请日2017-12-08
分类号G16B5/00(20190101);
代理机构31203 上海顺华专利代理有限责任公司;
代理人李鸿儒
地址 200237 上海市徐汇区梅陇路130号
入库时间 2022-08-23 12:37:47

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