本发明公开了水稻镉积累分子标记及其在改良水稻籽粒镉积累上的应用。本发明公开的水稻镉积累分子标记为水稻7号染色体8899129‑9307609区域的DNA片段，其为lcrf1或lcrf2，lcrf1为水稻7号染色体8899129‑9307609所示的DNA片段，所述lcrf2为序列表中SEQ ID No.1所示的DNA片段。本发明发现该水稻镉积累分子标记与水稻籽粒的镉积累有关，水稻镉积累分子标记为序列表中SEQ ID No.1的纯合水稻在高镉污染田种植具有籽粒镉低积累的特性。因此，可以通过杂交、回交等育种方法将该DNA片段导入其他背景来选育籽粒镉低积累的水稻新品种。
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