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基于氨基酸-核苷酸成对偏好性信息的蛋白质上与RNA结合模块的预测方法

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基于氨基酸‑核苷酸成对偏好性信息的蛋白质上与RNA结合模块的预测方法，属于蛋白质‑RNA相互作用与识别技术领域。第一步，以蛋白质三维结构中的每个氨基酸残基为中心，将与之有接触的所有残基划分为一个模块；然后剔除所有的不包含任何表面残基的内部模块，保留至少含有一个表面残基的表面模块；第二步，对表面模块定义三个参数：模块的界面偏好性模块内部接触面积Q和模块溶剂可接近表面积A，计算三者的乘积值PPQA，并将模块按照PPQA值由高到低进行排序，排在前两位的模块被识别为蛋白质上RNA可能的结合模块。该方法识别非核糖体RNA结合单链蛋白质上的结合模块有很好的效果，成功率较高。

著录项

公开/公告号CN108959852B

专利类型发明专利
公开/公告日2021-12-24

原文格式PDF
申请/专利权人北京工业大学;
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申请/专利号CN201710374897.8
发明设计人李春华;马梦琳;巩卫康;刘洋;
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申请日2017-05-24
分类号G16B30/00(20190101);G16B40/00(20190101);
代理机构11203 北京思海天达知识产权代理有限公司;
代理人张立改
地址 100124 北京市朝阳区平乐园100号
入库时间 2022-08-23 12:59:51

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