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一种基于细菌基因组高通量测序数据鉴定细菌种群携带的质粒类型的方法

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本发明公开了一种基于细菌基因组高通量测序数据鉴定细菌种群携带的质粒类型的方法。该方法通过对细菌的若干菌株高通量测序数据进行分析和数据拼接，对其所包含的质粒进行鉴定和分型。本发明可在短时间内对大量细菌测序数据进行分析，获得其中包含的质粒类型、耐药/毒力基因等。本发明可作为传统实验室鉴定生物实验的有益补充，达到快速鉴定质粒的目的。本发明具有重要的应用价值。

著录项

公开/公告号CN113782100B

专利类型发明专利
公开/公告日2022-02-18

原文格式PDF
申请/专利权人中国人民解放军军事科学院军事医学研究院;
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申请/专利号CN202111322948.5
发明设计人赵月峨;周冬生;王鹏;殷喆;赵晓冬;胡凌飞;吴妮尔;
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申请日2021-11-10
分类号G16B30/10(20190101);G16B50/00(20190101);
代理机构11245 北京纪凯知识产权代理有限公司;
代理人闫书宁
地址 100850 北京市海淀区太平路27号院
入库时间 2022-08-23 13:07:25

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1. 一种基于细菌基因组高通量测序数据鉴定细菌种群携带的质粒类型的方法 [P] . 中国专利： CN113782100B . 2022.02.18
2. 一种基于细菌基因组高通量测序数据鉴定细菌种群携带的质粒类型的方法 [P] . 中国专利： CN113782100A . 2021-12-10
3. RECOMBINANT PLASMIDE DNA pVar15-HIV-LTR, CARRYING CLONED FRAGMENT GENOME HIV OF 1 TYPE FROM CONSERVATIVE SITE OF 5-LTR SEQUENCE, RECOMBINANT PLASMIDE DNA pBluKSM-HIV-LTR mod CARRYING CLONED MODIFIED FRAGMENT OF SAME SITE GENOME HIV OF 1 TYPE, TEST SET FOR QUANTITATIVE EXPRESS IDENTIFICATION OF GENOME HIV-1 OF ANY TYPE IN ASSAY AND METHOD WITH ITS USE [P] . 俄罗斯专利： RU2350650C2 . 2009-03-27

机译：重组质粒DNA pVar15-HIV-LTR，携带来自5-LTR序列保守位点的1型克隆片段基因组HIV，重组质粒DNA pBluKSM-HIV-LTR mod携带同一位点基因组HIV-1的克隆修饰片段定量鉴定任何类型的基因组HIV-1的方法及其使用方法
4. Stable strains of xylose and arabinose fermenting zymomonas mobilis, transposon for insertion, stable of alien genes within a bacterial genome, plasmid vector containing said transposon, bacteria transformed with said plasmid, vector pzb1862-idhl-ara atcc with ascension number pta-1798, transposable element mini-tn5-tal / tkt-xilaxilb atcc with ascension number pta-1795, bacterium strain g8 atcc with ascension number pta-1796, bacterium strain c25 atcc with ascension number pta-1799, ax atcc bacterial strain with ascension number pta-1797, reaction mixture comprising fermentable medium [P] . BR0110987A . 2006-02-07

机译：木糖和阿拉伯糖发酵的运动发酵单胞菌的稳定菌株，用于插入的转座子，细菌基因组内的外源基因稳定，含有所述转座子的质粒载体，用所述质粒转化的细菌，载体pzb1862-idhl-ara atcc，提升编号pta-1798，可转座元件编号：tn5-tal / tkt-xilaxilb atcc，升序编号为pta-1795，细菌菌株g8 atcc，升序编号为pta-1796，细菌菌株c25 atcc，升序编号为pta-1799，ax atcc细菌菌株，编号为pta-1797 ，包含可发酵培养基的反应混合物
5. The recombinant plasmid DNA pVar 15-HIV-LTR, cloned genomic fragments SUPPORTING HIV-1 type from conserved regions of 5'-LTR Sequences, recombinant plasmid DNA pBluKSM-HIV-LTR mod, CARRIER cloned modified fragment of the same part of the HIV genome type 1 test KIT FOR RAPID IDENTIFICATION OF QUANTITATIVE genome of HIV-1 in the sample ANY KIND AND METHOD with its use [P] . 俄罗斯专利： RU2006112788A . 2007-10-27

机译：重组质粒DNA pVar 15-HIV-LTR，克隆的支持5'-LTR序列保守区的HIV-1类型的基因组片段，重组质粒DNA pBluKSM-HIV-LTR mod，CARRIER克隆了HIV同一部分的修饰片段基因组类型1测试试剂盒，用于快速鉴定样品中HIV-1的定量基因组任何种类和方法，及其使用