本发明涉及一种拟斯卑尔脱山羊草基因Pm6SS‑1及其分子标记和应用，属于基因工程领域；本发明所述的基因Pm6SS‑1，来自于拟斯卑尔脱山羊草，其编码区序列为SEQ ID NO.1，cDNA序列为SEQ ID NO.2，编码的氨基酸序列为SEQ ID NO.3；本发明通过实验验证了拟斯卑尔脱山羊草Pm6SS‑1基因及其编码的蛋白质在小麦抗白粉病育种中具有重要应用价值；本发明根据Pm6SS‑1基因的启动子序列（SEQ ID NO.4）开发了一个诊断性分子标记MBH2，通过实验证实MBH2可在小麦群体中有效追踪Pm6SS‑1基因，并能区分Pm6SS‑1基因和Pm21基因，在分子标记辅助育种中具有实用价值。
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