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基于FPGA的基因测序加速比对方法及装置

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摘要

本发明涉及一种基于FPGA的基因测序加速比对方法、装置、终端设备和存储介质，通过获取待定位的基因序列；根据第一线程中的预先设置的定位算法，对所述待定位的基因序列进行处理，得到多个局部匹配；通过第二线程对所述多个局部匹配进行处理，得到待定位的基因序列在预设基因参考序列中的位置,通过本发明实施例，对不同类型的线程任务进行负载均衡，并通过预先设置的定位算法加快对基因序列的定位，以在全基因组参考序列上获得基因测序比对序列的匹配位置及匹配质量，提高匹配效率。

著录项

  • 公开/公告号CN114334008B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-08-02

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 广州明领基因科技有限公司;

    申请/专利号CN202210077365.9

  • 发明设计人 王阳开;张力;陈墩金;林凯翔;毕星浩;

    申请日2022-01-24

  • 分类号G16B30/10(2019.01);G16B50/00(2019.01);

  • 代理机构北京秉文同创知识产权代理事务所(普通合伙) 11859;北京秉文同创知识产权代理事务所(普通合伙) 11859;

  • 代理人张文武;陈少丽

  • 地址 510630 广东省广州市天河区天河北路894号301房自编301号

  • 入库时间 2022-09-06 00:38:11

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