本发明提供一种三疣梭子蟹性别鉴定标记，是分布在核酸序列为SEQ ID NO:1的片段上的6个性别连锁的SNP位点，分别是153CT、185GA、214TC、236T(A,C)、251TC、261AT。本发明再一个方面提供检测三疣梭子蟹的雌雄性别的方法，是通过检测三疣梭子蟹性别鉴定标记来辨别三疣梭子蟹的雌雄性别。本发明所提供的分子标记中的6个SNP位点在1雄性个体中均呈现二等位基因杂合型，而在雌性个体中均呈现等位基因纯合型，可以采用两种方法进行检测，检测方法灵活，结果稳定，其中高分辨率溶解曲线的检测方法通量较高，检测速度快，应用简单，为三疣梭子蟹全雌苗种的繁育提供重要工具。
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