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Local-global alignment for finding 3D similarities in protein structures

机译:在蛋白质结构中发现3D相似性的局部全局比对

摘要

A method of finding 3D similarities in protein structures of a first molecule and a second molecule. The method comprises providing preselected information regarding the first molecule and the second molecule. Comparing the first molecule and the second molecule using Longest Continuous Segments (LCS) analysis. Comparing the first molecule and the second molecule using Global Distance Test (GDT) analysis. Comparing the first molecule and the second molecule using Local Global Alignment Scoring function (LGA_S) analysis. Verifying constructed alignment and repeating the steps to find the regions of 3D similarities in protein structures.
机译:一种在第一分子和第二分子的蛋白质结构中发现3D相似性的方法。该方法包括提供关于第一分子和第二分子的预选信息。使用最长连续链段(LCS)分析比较第一个分子和第二个分子。使用全球距离测试(GDT)分析比较第一个分子和第二个分子。使用局部全局比对评分功能(LGA_S)分析比较第一个分子和第二个分子。验证构建的比对并重复步骤以发现蛋白质结构中的3D相似性区域。

著录项

  • 公开/公告号US8024127B2

    专利类型

  • 公开/公告日2011-09-20

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 ADAM T. ZEMLA;

    申请/专利号US20040782061

  • 发明设计人 ADAM T. ZEMLA;

    申请日2004-02-18

  • 分类号G01N33/48;

  • 国家 US

  • 入库时间 2022-08-21 18:09:57

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