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DHA高产裂殖壶菌EST文库的构建与分析

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DHA(Docosahexaenoic acid,二十二碳六烯酸)是重要的ω-3高度不饱和脂肪酸之一,具有各种重要生理功能.本文构建了Schizochytrium sp.FJU-512 cDNA文库,其原始文库库容为5.0×106 cfu;从5'端测序,共获得4005条高质量EST(Expressed sequence tag,表达序列标签),平均长度470 bp,ESTs经拼接获得1947条unigenes;利用Blast将Unigenes与NCBI蛋白数据库和核酸数据库进行比对,其中878条Unigenes(45.10％)与蛋白数据库和中已报道的蛋白具有同源性(E＜10-5),168条Unigenes(8.51％)与核酸数据库中已报道的基因具有同源性(E＜10-10);Schizochytrium cDNA文库中高度保守的基因(E＜10-100)主要有:α/β-微管蛋白、肌动蛋白A、蛋白磷酸化酶Ⅰ、腺苷高半胱氨酸酶、高度不饱和脂肪酸合成酶、G蛋白β亚基、α-谷胱苷肽S-转移酶、甘油醛-3-磷酸脱氢酶;与真核模式生物基因的同源性比较表明,Schizochytrium与真核模式生物共有的高度保守基因主要是编码α-微管蛋白1、肌动蛋白A以及甘油醛-3-磷酸脱氢酶的基因;根据基因命名词汇体系,对具有注释信息的基因进行了功能分类,结果表明结合与催化活性占细胞分子功能的比重较大(分别为36.00％与41.55％);利用pfam将Unigenes与功能确定的蛋白质家族进行匹配搜索,当E＜10-2时,605个unigenes(31.07％)与蛋白家族388个结构域相匹配.Schizochytrium cDNA文库的构建与分析,为研究Schizochytrium脂肪酸生物合成PKS途径奠定基础.

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来源
《2006全国海洋生物技术与海洋药物学术会议暨全国第九届海洋药物学术研讨会》|2006年|700-710|共11页
会议地点大连
作者
江贤章; 黄建忠;
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作者单位

中国药学会;

中国生物化学与分子生物学会;

中国生物工程学会;

中国微生物学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类微生物生物化学;
关键词
高度不饱和脂肪酸; 二十二碳六烯酸; 裂殖壶菌; cDNA文库;

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