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基于皱皮软海绵宏基因组的PKS基因筛选的研究

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提取皱皮软海绵及其共附生微生物的宏基因组DNA,使用聚酮合酶(PKS)基因的酮酰合酶(KS)域引物PCR扩增PKS基因片段获得一条671bp的片段,以pUCm-Tvector为载体将该基因片段克隆到大肠杆菌中,从阳性克隆中分离出PKS基因片段,测序推导出氨基酸序列.通过BLAST比对发现此氨基酸序列与红细菌目的Rhodobacterales bacterium PKS基因KS域的氨基酸序列有96％的同源性.通过基于氨基酸序列的系统发育分析,推测此筛选得到的PKS基因属于trans-AT型.本文首次证实了皱皮软海绵中存在细菌来源的PKS基因,这对于证明海绵活性物质微生物来源假说提供了有力证据.同时,本文也为今后从基因水平利用尚不可分离培养的海绵共生微生物资源提供了基础.

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来源
《2006全国海洋生物技术与海洋药物学术会议暨全国第九届海洋药物学术研讨会》|2006年|670-673|共4页
会议地点大连
作者
张戌升; 李志勇; 缪晓玲;
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作者单位

中国药学会;

中国生物化学与分子生物学会;

中国生物工程学会;

中国微生物学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类水生生物遗传学;
关键词
皱皮软海绵; 宏基因组; 聚酮合酶基因; PCR扩增; 序列分析;

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