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首页> 中文会议>第十一届全国子宫颈癌前期病变、子宫颈癌热点研讨会暨子宫肿瘤高峰论坛 >表达谱基因芯片筛选子宫颈癌甲基化差异基因的研究

表达谱基因芯片筛选子宫颈癌甲基化差异基因的研究

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目的：筛选人乳头瘤病毒(HPV)阳性宫颈癌细胞系中由于HPV感染诱导沉默的特异抑癌基因,探讨HPV感染可能导致抑癌基因发生甲基化的机制.rn 方法：选取HPV阳性HeLa和Caski宫颈癌细胞系和HPV阴性C-33A和HT-3宫颈癌细胞系,分别经去甲基化药物5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-Aza-CdR,Aza)处理,采用Agilent人类全基因组表达谱芯片检测Aza处理前后细胞全基因组的表达水平,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证芯片结果,亚硫酸氢盐-基因组测序法(BGS)检测目的基因甲基化水平.rn 结果：①芯片结果显示:HPV阳性和阴性细胞系共721条基因表达存在差异.②用药后表达显著上调的基因:HeLa细胞系825条,Caski细胞系815条,C-33A细胞系1023条,HT-3细胞系1196条.HeLa和Caski细胞系共表达上调的基因为182条,剔除阴性细胞系共表达上调基因,筛选出阳性细胞系HPV相关表达上调基因97条,与阴性细胞系基因表达比较,差异有统计学意义(P＜0.01),最终筛选出13条差异表达基因,其中具有功能者7条.③RT-qPCR结果:筛选基因在宫颈癌细胞系中的表达与芯片检测结果一致;HPV阳性宫颈癌细胞系中甲基化频率明显高于阴性细胞系,支持芯片结果.rn 结论：筛选出的7条新的潜在抑癌基因可能由于HPV感染诱导发生甲基化而沉默,为进一步探讨HPV诱导抑癌基因发生甲基化的机制提供实验基础.

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