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中华鳖(Pelodiscus sinensis)HMG1基因的克隆与序列分析

摘要

利用RT-PCR,从中华鳖肝脏组织的总RNA中,克隆了中华鳖全长HMG1基因,该cDNA序列长度为669 bp,起始密码子(ATG)和终止密码子(GAA)分别位于第6和第203个密码子位置,包含一个编码202个氨基酸的开放读码框(ORF)。中华鳖HMG1多肽链含有三个保守的结构区域(即HMG1盒区,HMG2盒区,多酸性氨基酸区域)。Blast分析表明,中华鳖HMG1基因与人、家鼠、中国仓鼠、原牛、野猪、红原鸡、虹鳟的HMG1基因有高度的AA同源性,序列与结构的保守性暗示了中华鳖HMG1基因的功能在进化中可能始高度保守的。分子系统发生分析进一步表明,中华鳖HMG1基因的HMG盒区1和HMG盒区2在进化中是互相独立的。本研究始首次报道爬行动物(中华鳖)的HMG1基因。

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