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枇杷苯丙氨酸解氨酶(PAL1)基因全长cDNA的克隆及序列分析

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本研究以‘解放钟’枇杷(Eriobotrya japonica Lindl.)为试验材料,应用同源克隆与RACE扩增技术,获得枇杷苯丙氨酸解氨酶(PAL1)基因的全长cDNA序列,并对序列进行了生物信息学分析,为今后枇杷PAL1基因的时空表达以及相关代谢通路的研究提供理论基础.结果表明,本研究克隆获得的PAL1基因的cDNA,全长2498bp,最大开放阅读框为2163bp,编码了720个氨基酸的蛋白,理论分子量为78.5705kDa,理论的等电点为pI=6.12;PAL1基因进化树分析表明,进化树分支拓扑结构与表观分类结果基本相符,枇杷PAL1基因与同属蔷薇科的苹果和梨的亲缘关系最近;蛋白质多序列比对分析表明,PAL1蛋白保守性高;蛋白质功能结构域预测结果显示枇杷PAL1属于裂解酶超家族,具PAL酶的标志性活性结构域“GTITASGDLVPLSYIAG”;三维结构分析显示,枇杷PAL1蛋白模型为典型的PAL复合体结构.由此可见,本研究成功克隆了PAL1基因序列,该序列具有典型的PAL特征.

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来源
《第八届全国枇杷学术研讨会》||98-107|共10页
会议地点重庆
作者
林大河; 林授锴; 张燕清; 吴锦程;
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作者单位

中国园艺学会;

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会议组织
正文语种
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中图分类
关键词
枇杷; 冷藏过程; 苯丙氨酸解氨酶; 反向转录脱氧核糖核酸; 基因克隆; 基因序列;

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