大黄鱼mtDNA ND5和cytb基因的克隆与序列分析

摘要

通过设计特异性引物对大黄鱼线粒体DNA(mtDNA)辅酶5(ND5)和细胞色素b(cytb)基因进行PCR扩增.扩增产物经琼脂糖电泳检测、纯化后直接测序.结果得到ND5的序列1839bp和cytb基因序列382bp.应用primerpremier5和MEGA3软件包所作的系统发育分析表明:依据大黄鱼ND5序列所作的进化树总体支持传统的分类地位,大黄鱼更接近塘鳢鱼科.而基于cytb基因所作的分析表明黑鳃梅童鱼是大黄鱼在石首鱼科中是遗传距离最小的;同时可以发现ND5基因序列可以被用来研究鲈形目不同科之间鱼类的系统发育分析.本实验同时还预测出ND5和cytb的氨基酸序列,为进一步研究打下坚实的基础,为大黄鱼的分子辅助育种和种质改良工作提供了丰富的功能基因研究资料.

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