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Micromonospora chalcea FIM 02-523全基因组及其次级代谢产物Rakicidins的生物合成基因簇分析

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青铜小单孢菌(Micromonospora chalcea,M.chalcea)FIM02-523能够合成对乏氧肿瘤细胞、艰难梭菌等具有活性的一组化合物Rakicidins.利用Illumina HiSeq高通量测序平台,本研究首次对M.chalcea FIM02-523进行全基因组测序,得到总长约6.74Mb的序列信息,利用AntiSMASH预测基因组中存在19个生物合成基因簇.结合Rakicidins化学结构特点,定位到了Rakicidins的生物合成基因簇,并初步推测其生物合成途径:以脂肪酸侧链作为起始物,甲基丙二酰COA、甲基丙二酰COA、丝氨酸、丙二酰COA、甘氨酸、天冬酰胺等依次参与生物合成,经环化与后修饰,最终形成Rakicidins.研究为M.chalcea FIM02-523的功能基因组学研究和代谢调控提供了理论基础.

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来源
《第十三届全国抗生素学术会议》|2017年|168-175|共8页
会议地点福州
作者
方志锴; 江红; 连云阳;
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作者单位

中国药学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类药物生物学;
关键词
青铜小单孢菌; 全基因组测序; 次级代谢产物; 生物合成基因簇; 药物活性;

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