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基于RNA测序技术的葱蝇转录组分析

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本文以葱蝇(Delia antiqua)为研究对象,运用新兴的RNA高通量测序技术对其开展转录组测序、组装和生物信息学分析.对葱蝇转录组测序,得到53,814,782条原始Reads,总核苷酸数为4,634,750,520nt.其中,未知碱基、GC含量、Q20的百分比分别为0.00％、98.24％和39.03％.对原始Reads进行拼接组装,得到29,659条Unigene,与Nr数据库、Nt数据库、Swissprot数据库、KEGG数据库、GO分类和COG数据库比对,分别有21,041、10,023、15,873、14,182、6,600个转录本被注释或分类.本研究的结果丰富了葱蝇cDNA数据资源,为探讨葱蝇相关基因的分子特性,进化规律及功能奠定了坚实的基础;对认知葱蝇滞育及其调控的分子机理具有重要的科学意义.

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来源
《重庆市昆虫学会2012年学术交流及研讨会》|2012年|83-89|共7页
会议地点重庆
作者
Che Yanfei; 车燕飞; Zhang Yujuan; 张玉娟; Chen Bin; 陈斌;
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作者单位

重庆市昆虫学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 Q969.454.103;
关键词
葱蝇; 转录组基因; RNA测序技术; 分子特性; 进化规律;

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