猪戊肝病毒存在准种现象

摘要

戊型肝炎病毒(HEV)属于肝炎病毒科肝炎病毒属,基因组含3个阅读框。第1阅读框编码RNA依赖的RNA聚合酶、甲基转移酶等,第2阅读框编码病毒外壳蛋白,第3阅读框与第2阅读框相重叠,编码与病毒释放有关的蛋白。越来越多的证据表明,戊型肝炎(HE)是一种人兽共患病,猪是HEV最主要的动物贮存宿主。为研究猪戊肝病毒准种存在情况,采用逆转录-巢式聚合酶链反应法(RT-nested-PCR)对四株猪戊肝病毒(Hepatitis E virus)第2开放阅读框(ORF2)部分序列进行PCR扩增,将产物克隆后,每个毒株分别随机挑取20个阳性克隆测序,进行DNA序列分析。结果显示4株HEV不同克隆间的ORF2核苷酸序列同源性分别为96.8%~99.7%,98.8%~99.7%,98.8%~99.7%和100%,有变异的克隆株核苷酸序列与上海株(SAAS-JDY5) 同源性为96.8%~100%。由此证实了感染戊肝病毒的猪个体内有HEV准种的存在。

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