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Some results on topological colored motifs in metabolic networks

机译:关于代谢网络中拓扑彩色图案的一些结果

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摘要

In this work, we address the topological colored motif search problem in metabolic networks. This problem is a concern in biology, which seeks to describe the functions and the evolution of metabolism. Recently, several variations of this problem have been studied. Here, we present some hardness results for finding motifs. Furthermore, we describe the first polynomial algorithm for the case in which the motif is a colorful tree. We also detail a data structure that allows finding all of these types of motifs in a metabolic network.
机译:在这项工作中,我们解决了代谢网络中的拓扑彩色基元搜索问题。这个问题是生物学中的一个关注点,该生物学试图描述新陈代谢的功能和进化。最近,已经研究了该问题的几种变型。在这里,我们提出一些硬度结果以寻找图案。此外,我们描述了主题为彩叶树的情况下的第一个多项式算法。我们还详细介绍了一种数据结构,该结构允许在代谢网络中查找所有这些类型的基序。

著录项

  • 来源
    《》|2013年|1-5|共5页
  • 会议地点
  • 作者

    Araujo Eloi; Stefanes Marco A.;

  • 作者单位
  • 会议组织
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