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Shiny FHIR: An Integrated Framework Leveraging Shiny R and HL7 FHIR to Empower Standards-Based Clinical Data Applications

机译：Shiny Fhir：综合框架利用闪亮的R和HL7 FHIR来赋予基于标准的临床数据应用

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In this study, we describe our efforts in building a clinical statistics and analysis application platform using an emerging clinical data standard, HL7 FHIR, and an open source web application framework, Shiny. We designed two primary workflows that integrate a series ofR packages to enable both patient-centered and cohort-based interactive analyses. We leveraged Shiny with R to develop interactive interfaces on FHIR-based data and used ovarian cancer study datasets as a use case to implement a prototype. Specifically, we implemented patient index, patient-centered data report and analysis, and cohort analysis. The evaluation of our study was performed by testing the adaptability of the framework on two public FHIR servers. We identify common research requirements and current outstanding issues, and discuss future enhancement work of the current studies. Overall, our study demonstrated that it is feasible to use Shiny for implementing interactive analysis on FHIR-based standardized clinical data.
机译：在这项研究中，我们描述了我们使用新兴临床数据标准，HL7 FHIR和开源Web应用程序框架构建临床统计和分析应用平台的努力，闪亮。我们设计了两个主要的工作流程，集成了一系列R系列，以实现患者居中的和基于队列的交互式分析。我们利用闪亮与R开发基于FHIR的数据的交互式界面，并使用卵巢癌研究数据集作为用于实现原型的用例。具体而言，我们实施了患者指数，以患者为中心的数据报告和分析，以及队列分析。通过测试两个公共FHIR服务器对框架的适应性来进行我们研究的评估。我们确定常见的研究要求和当前的突出问题，并讨论了目前研究的未来增强工作。总体而言，我们的研究表明，使用闪亮来实施基于FHIR的标准化临床数据的互动分析是可行的。

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