芒果主产区砧木种质资源遗传多样性SSR标记研究

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第一章 序言

1.1 芒果的基本概况

1.1.1 芒果的分布

1.1.2 栽培意义

1.1.3 芒果分类

1.2 芒果的研究及应用现状

1.2.1 芒果种质资源收集和保存

1.2.2 遗传研究

1.2.3 育种研究

1.2.4 生理生化研究

1.3 芒果炭疽病研究

1.4 遗传多样性的研究

1.4.1 遗传多样性研究的意义

1.4.2 遗传多样性研究的方法

1.5 常用的DNA分子标记技术

1.5.1 基于DNA杂交的分子标记

1.5.2 基于PCR技术的分子标记

1.5.3 以重复序列为基础的分子标记

1.6 分子标记在芒果上的应用

1.6.1 SSR标记技术

1.6.2 RAPD标记技术

1.6.3 AFLP标记技术

1.6.4 其他标记技术

1.7 本研究的目的和意义

第二章 芒果SSR-PCR反应体系的优化

2.1 材料与方法

2.1.1 材料

2.1.2 试剂及仪器

2.1.3 药品配制

2.1.4 基因组DNA的提取

2.1.5 基因组DNA质量检测

2.1.6 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳与银染

2.1.7 SSR引物序列

2.1.8 PCR的扩增和正交实验设计

2.2 结果与分析

2.2.1 PCR正交实验设计的结果

2.2.2 正交实验结果分析

2.2.3 引物退火温度的优化

2.2.4 引物退火时间的优化

2.2.5 循环次数的优化

2.2.6 最佳体系验证

2.3 讨论

第三章 不同芒果砧木种质资源SSR标记的遗传多样性分析

3.1 材料与方法

3.1.1 供试砧木材料

3.1.2 多态性SSR引物筛选

3.1.3 数据统计分析

3.2 结果与分析

3.2.1 DNA的纯度与浓度

3.2.2 DNA电泳检测

3.2.3 DNA的酶切效果分析

3.2.4 SSR引物的多态性

3.2.5 SSR引物扩增芒果砧木资源的结果

3.2.6 聚类分析

3.3 讨论

3.3.1 引物特异性

3.3.2 芒果砧木资源的遗传多样性

第四章 总结

4.1 DNA的提取

4.2 PCR操作

4.3 银染

4.4 体系的优化

4.5 芒果砧木资源SSR遗传多样性

参考文献

附录A 部分引物对116份砧木种质资源的SSR扩增图

附录B 116份砧木种质资源聚类图

作者简历

致谢