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系统性红斑狼疮小鼠肠道微生物菌群与抗dsDNA抗体水平的相关性研究

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目录

声明

中英文缩略词表

第1章 前言

第2章 材料与试剂

2.1 实验动物

2.2 主要仪器和设备

2.3 主要试剂

2.4主要分析软件

2.5实验用品制备

第3章 实验方法

3.1抗dsDNA抗体检测(具体见参考文献[38])

3.2 小鼠粪便收集

3.3粪便DNA的提取及电泳

3.4 PCR扩增

3.5 PCR产物的混样和纯化

3.6 文库构建和上机测序

3.7 数据分析与统计学方析

第4章 实验结果

4.1 抗dsDNA抗体检测

4.2 肠道微生物菌群生物学信息分析

第5章 讨论

5.1 肠道微生物菌群多样性与SLE的关系

5.2 肠道微生物菌群结构与SLE的关系

第6章 结论

致谢

参考文献

攻读学位期间的研究成果

综述: 肠道微生物菌群在自身免疫性疾病发生发展中作用的研究进展

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摘要

目的:探讨系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus,SLE)模型TC小鼠(基因型为B6.NZMSle1/2/3)的肠道微生物菌群结构与血清抗dsDNA抗体之间的相关性。 方法:收集SLE模型TC小鼠的血清,通过ELISA法检测血清中抗dsDNA抗体的水平,将小鼠分为抗dsDNA抗体阳性组和阴性组。将收集到的小鼠粪便样品,利用Illumina公司的HiSeq2500高通量测序,对粪便样品进行16S测序,分析两组之间的肠道微生物菌群结构与抗dsDNA抗体水平之间的关系。对微生物菌群的有效数据,采用 Qiime软件计算 ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数及UniFrac距离。使用R软件(Version2.15.3)进行Alpha多样性指数及Beta多样性指数的组间差异分析,并进行t检验。血清检测抗dsDNA抗体数据采用GraphPad Prism6软件进行t检验。以P<0.05为差异有统计学意义。 结果: ELISA检测显示,在SLE模型TC小鼠中85.8%的小鼠表现为血清抗dsDNA抗体阳性;14.2%的小鼠表现为阴性。SLE模型TC小鼠粪便测序结果显示,抗dsDNA抗体阳性组微生物物种群落多样性显著低于阴性组(P<0.05);同时,两组SLE模型TC小鼠肠道微生物菌群分别在绿弯菌门(Chloroflexi)水平;β变形菌纲(Betaproteobacteria)、δ变形菌纲(Deltaproteobacteria)和纤线杆菌纲( Ktedonobacteria)水平;伯克氏菌目( Burkholderiales)、脱硫弧菌目( Desulfovibrionales)和纤线杆菌目( Ktedonobacterales)水平;产碱菌科( Alcaligenaceae)和脱硫弧菌科( Desulfovibrionaceae)水平;副萨特氏菌属(Parasutterella)和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)水平差异均具有统计学意义(P<0.05)。 结论:SLE模型 TC小鼠肠道微生物菌群的物种多样性和结构与血清抗dsDNA抗体水平高度相关,提示肠道微生物菌群可能参与了SLE的发病。本研究为进一步阐明肠道微生物菌群在 SLE疾病发生和进展机制中的作用提供了理论基础。

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