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致谢
摘要
英文缩略词表
1 绪论
1．1 前言
1．2 蛋白-蛋白分子对接
1．2．1 蛋白-蛋白分子对接中常用的搜索算法
1．2．2 蛋白-蛋白分子对接中硬件加速策略
1．3 蛋白-蛋白对接中的打分函数
1．3．1 打分函数的分类
1．3．2 打分函数ZRANK、dDFire、FireDock的简介
2 基于能量项的打分函数HawkRank的设计
2．1 引言
2．2 材料与方法
2．2．2 蛋白-蛋白预测物的评价标准
2．2．3 基于SASA的蛋白溶剂化势能模型的参数化
2．2．4 HawkRank打分函数的设计
2．2．5 打分函数的评价标准
2．3 结果与讨论
2．3．1 基于SASA的蛋白溶剂化势能模型的训练结果
2．3．2 HawkRank的打分性能
2．3．3 RMSDs与打分函数得分之间皮尔森相关系数的对比
2．3．4 HawkRank的局限性
2．3．5 HawkRank的计算速度
2．4 本章小结
3 HawkRank软件及其在线打分网站
3．1 引言
3．2 HawkRank软件的设计与使用
3．2．2 HawkRank软件的使用方法
3．3 HawkRank打分网站的设计与使用
3．3．1 HawkRank打分网站的整体结构
3．3．2 HawkRank打分网站的功能介绍
参考文献
作者简历及在学期间所取得的科研成果
