英汉缩略语名词对照
第1 章 前言
1.1常染色体显性遗传骨硬化症II型概述
1.2常染色体显性遗传骨硬化症II型的分子机制
1.3常染色体显性遗传骨硬化症II型的疾病模型
1.3.1常染色体显性遗传骨硬化症II型的动物模型
1.3.2常染色体显性遗传骨硬化症II型的iPSC细胞模型
1.4非编码的RNA对破骨细胞形成的微环境的影响
1.5高通量测序技术
1.5.1全转录组测序技术在破骨细胞功能中的研究进展
1.5.2降解组测序技术在哺乳动物的研究进展
1.6本研究的目的与意义
第2 章 材料与方法
2.1实验材料
2.1.1细胞样本
2.1.2主要试剂
2.1.3主要仪器
2.2实验方法
2.2.1细胞免疫荧光染色分析
2.2.2 miRNA文库的构建和测序
2.2.3 lncRNA特异性文库的构建和测序
2.2.4 降解组文库的构建和测序
2.3生物信息学分析
2.3.1 mRNA和lncRNA的鉴定及分析
2.3.2 circRNA的鉴定及分析
2.3.3 miRNA的鉴定及分析
2.3.4 ceRNA调控网络的构建
2.3.5 降解组文库的生信分析
2.3.6 差异表达基因的qRT-PCR 验证
第3 章 实验结果
3.1 细胞免疫荧光染色分析
3.2细胞总RNA的质控分析
3.3测序数据质控分析
3.3.1 lncRNAs 特异性文库的质控分析
3.3.2 miRNAs 文库的质控分析
3.3.3降解组学文库的质控分析
3.4 mRNA表达谱
3.4.1 转录本的表达量的统计分析
3.4.2 差异表达基因的筛选
3.4.3 差异表达基因的功能富集
3.4.4 miRNA-mRNA的调控网络
3.5 lncRNA表达谱
3.5.1 lncRNA的鉴定
3.5.2 lncRNAs 和mRNAs 的特征比较
3.5.3 差异表达的lncRNAs 的筛选
3.5.4 差异表达的lncRNAs 靶基因功能富集分析
3.5.5 lncRNA-miRNA调控网络
3.6 circRNA表达谱
3.6.1 circRNA的鉴定
3.6.2 差异表达的circRNAs 的筛选
3.6.3 差异表达的circRNAs 靶基因功能富集分析
3.6.4 circRNA-miRNA 的调控网络
3.7 miRNA表达谱
3.7.1 miRNA的鉴定
3.7.2 差异表达的miRNAs 筛选
3.8降解组学测序鉴定miRNA的靶基因
3.8.1 miRNA靶基因的鉴定
3.8.2 差异表达的miRNA的靶基因的功能注释
3.8.3 差异表达的miRNA的靶基因的功能富集
3.9 ceRNA调控网络
3.10 全转录组测序中基因的qRT-PCR验证
第4 章 讨论
4.1 ADO2-iPSCs 细胞核心基因的鉴定及表达调控
4.2 非编码基因在ADO2-iPSCs细胞中的表达及调控作用
4.2.1 circRNA在ADO2-iPSCs 细胞中的表达及调控
4.2.2 lncRNA在ADO2-iPSCs 细胞中的表达及调控
4.2.3 miRNA在ADO2-iPSCs 细胞中的表达及调控
4.3 miRNA的候选靶基因功能富集分析
第5 章 结论与展望
5.1结论
5.2不足之处及未来展望
5.2.1不足之处
5.2.2展望
参考文献
附录
攻读硕士学位期间发表论文情况
致谢
声明
广西师范大学;
