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哮喘相关的miR-201-3p靶基因的预测及生物信息学分析

         

摘要

目的:预测并分析miR-201-3p的靶基因.方法:利用miRanda、miRDB、miRWalk和Targetscan等4个数据库在线预测miR-201-3p的靶基因,对获得的靶基因用Cytoscape软件中的BiNGO插件进行Gene Ontology (GO)分类及KEGG数据库的信号转导通路富集分析.结果:共预测获得1082个靶基因.经GO分析这些靶基因后,共得到涉及245条生物学进程,主要包括细胞进程、生物学调节和生物学进程调节等;分子功能包括蛋白质异源二聚体活化和I-SMAD蛋白结合等.KEGG富集分析发现这些靶基因主要参与MAPK信号通路、T细胞受体信号通路、Wnt信号通路、趋化因子信号通路等与炎症有关的信号通路.结论:成功预测了miR-201-3p的靶基因,部分靶基因可能参与了哮喘气道炎症和气道重塑.

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