水稻苯达松敏感致死基因(ben)的电子杂交定位和基因预测

杨剑波; 向太和; 李莉; 王永杰; 黄大年

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水稻苯达松敏感致死基因(ben)的电子杂交定位和基因预测

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来自水稻突变体的苯达松敏感致死基因(ben)能够作为一种除草剂筛选标志用于杂交水稻种子的安全生产.本研究利用我们已得到的与Ben/ben基因紧密连锁的两个RAPD标记(OPG18/972,OPG18/943)以及与该标记高度同源的跨叠克隆Contig10968(来自中国水稻基因组框架序列,全长8 273 bp)的序列信息,沿标记的两端设计新的PCR引物,以携带苯达松抗性基因(Ben)和苯达松敏感基因(ben)的水稻近等基因系为模板,通过对扩增产物的序列拼接和比对,成功地将OPG18/972和OPG18/943标记从972 bp和943 bp步移延伸到8 138 bp和8 103 bp(提交到GenBank的登记号分别为 AY181204 和AY181203).并利用电子杂交将延伸后的序列定位于水稻第2染色体上150.5 cM处,在对标记两端及其附近的序列进行生物信息学分析后,我们初步预测Ben基因可能是编码某种受体蛋白的基因或催化6-OH-苯达松与葡萄糖缀合的淀粉合成酶类似基因.

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来源
《作物学报》 |2004年第11期|1152-1158|共7页
作者
杨剑波; 向太和; 李莉; 王永杰; 黄大年;
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作者单位

安徽省农业科学院水稻研究所,安徽,合肥,230031;

安徽省农业科学院水稻研究所,安徽,合肥,230031;

安徽省农业科学院水稻研究所,安徽,合肥,230031;

安徽省农业科学院水稻研究所,安徽,合肥,230031;

中国水稻研究所,浙江,杭州,310006;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类稻;
关键词
水稻; 苯达松敏感致死基因; 定位; 预测; 电子杂交;

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