VEGFR2活性腔性质以及与抑制剂的结合模式研究

陈军; 盛春泉; 郑灿辉; 李耀武; 吕加国; 张万年; 周有骏; 朱驹

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VEGFR2活性腔性质以及与抑制剂的结合模式研究

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VEGFR2介导肿瘤诱导的血管生成作用,是抑制肿瘤生长和转移的新靶点.为深入探讨VEGFR2活性腔性质以及与抑制剂的结合模式,采用多拷贝同时搜寻法(MCSS)研究VEGFR2活性腔的性质,然后用分子对接方法对5个已上临床的VEGFR抑制剂与VEGFR2活性腔进行对接计算,讨论它们的结合模式,确定与配体结合相关的关键残基.研究发现:疏水腔Ⅰ,Ⅱ是配体结合的关键区域,残基Glu915,Cys917是关键的氢键作用位点,Lys866,Glu883和Asp1044形成的极性区域对提高配体亲合力很重要,疏水腔Ⅲ和极性腔Ⅳ是额外增强配体结合力的区域,Ⅳ区的Arg1030可提供额外的氢键作用位点.本研究可为全新VEGFR2抑制剂的合理药物设计提供理论依据,为寻找新的抗肿瘤药物奠定基础.

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来源
《化学学报》 |2007年第6期|547-552|共6页
作者
陈军; 盛春泉; 郑灿辉; 李耀武; 吕加国; 张万年; 周有骏; 朱驹;
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作者单位

第二军医大学药学院;

上海;

200433;

第二军医大学药学院;

上海;

200433;

第二军医大学药学院;

上海;

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第二军医大学药学院;

上海;

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第二军医大学药学院;

上海;

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第二军医大学药学院;

上海;

200433;

第二军医大学药学院;

上海;

200433;

第二军医大学药学院;

上海;

200433;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类化学;
关键词
多拷贝同时搜寻; 分子对接; VEGFR抑制剂;

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