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几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂

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由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R2引导的区域选择法(q2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q2值均比传统CoMFA的高.q2-GRS方法得到的q2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q2较为理想,而在CoMSIA中,q2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.

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来源
《化学学报》 |2003年第7期|1129-1135|共7页
作者
聂晶; 董喜成; 潘家祜;
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作者单位

复旦大学药学院;

上海;

200032;

中国科学院上海有机化学研究所计算机化学重点实验室;

上海;

200032;

复旦大学药学院;

上海;

200032;

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正文语种 chi
中图分类化学;
关键词
比较分子场分析(CoMFA);

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