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腾冲嗜热菌单链DNA结合蛋白SSB2和SSB3新的单链DNA结合特性(英文)

         

摘要

【目的】揭示腾冲嗜热菌中两个单链DNA结合蛋白SSB2和SSB3的全新的底物结合功能及其不同的体内表达模式。【方法】利用腾冲嗜热菌复制起始位点附近的长度较短的单链DNA为底物,采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及Western blot方法,研究SSB2和SSB3体外单链DNA结合特征和体内表达模式。【结果】SSB2与35nt的复制起始区单链DNA(ssDNA)结合,形成单个SSB2-DNA复合物;当与59ntssDNA结合时,可以随着蛋白浓度的递增形成一个或两个SSB2-DNA复合物;而与70nt的单链DNA结合时,则形成1~3个SSB2-DNA复合物。这些结果说明SSB2在与长度小于70nt的单链DNA结合时,存在着多种构型。而这些构型的形成取决于单链DNA的长度、蛋白的浓度,并与SSB蛋白所受的预处理温度和反应温度有关。SSB3与59nt和70nt结合时,最多形成3个或4个复合物。低温保存和高温下反应对SSB3蛋白的功能影响比SSB2更为显著,表现为构型明显减少或结合ssDNA能力下降。此外,在腾冲嗜热菌中,SSB2和SSB3的表达水平随温度变化而变化,SSB2在45℃~65℃间表达水平很高,在75℃时表达水平下降,而SSB3在45℃时表达水平较低,在55℃到75℃间表达水平较高,说明二者在腾冲嗜热菌中的表达可能受到培养温度的调控。【结论】腾冲嗜热菌中SSB2和SSB3具有全新的底物结合特征及其不同的体内表达模式。

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