3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性

孙倪悦; 陆涛; 陈亚东; 郝兰虎; 许岩; 李瑞君

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细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义.

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来源
《物理化学学报》 |2009年第4期|645-654|共10页
作者
孙倪悦; 陆涛; 陈亚东; 郝兰虎; 许岩; 李瑞君;
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作者单位

中国药科大学基础部,南京,210009;

中国药科大学基础部,南京,210009;

中国药科大学基础部,南京,210009;

中国药科大学基础部,南京,210009;

中国药科大学基础部,南京,210009;

中国药科大学基础部,南京,210009;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类结构化学;
关键词
细胞周期蛋白激酶; 吲哚咔唑衍生物; 3D-QSAR; 3D-QSSR; 比较分子力场分析方法; 分子对接;

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