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大菱鲆钙激活型钾离子通道基因TSKCa的克隆和序列分析

         

摘要

钙激活型钾离子通道蛋白(KCa)是位于细胞膜表面调节细胞功能的一类膜蛋白.通过设计特异性引物,以我国海水养殖大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)血液cDNA为模板,利用RT-PCR 技术克隆获得了一条基因片段.生物信息学分析证实该片段来自钙激活型钾离子通道基因SKCa (小电导钙激活型钾通道)家族.设计巢式PCR引物,通过5′RACE和3′RACE分别克隆得到了该基因的5′端序列和3′端序列.使用生物学软件拼接3段序列得到了大菱鲆钙激活型钾离子通道TSKCa基因的全长序列.TSKCa基因cDNA全长为1 698 bp,其中开放阅读框长度为1 632 bp,编码的TSKCa蛋白有544个氨基酸.比对TSKCa蛋白与GenBank中已有的SKCa蛋白序列,证实其序列同源性很高.使用网络DAS和srsbin服务器对TSKCa蛋白进行跨膜结构预测和疏水性分析,并结合已有的研究结果推测TSKCa蛋白的结构由S1~S6六个跨膜结构域和一个孔道区(P区)组成.

著录项

  • 来源
    《海洋科学进展》 |2008年第2期|207-213|共7页
  • 作者单位

    国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;

    海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061;

    国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;

    海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061;

    国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;

    海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061;

    国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;

    海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061;

    国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;

    海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061;

    国家海洋局,第一海洋研究所,山东,青岛,266061;

    海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室,山东,青岛,266061;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 转化及克隆;
  • 关键词

    钙激活; 钾离子通道; 大菱鲆; 基因克隆;

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