新型微小RNA-9对乳腺癌增殖的影响及靶基因预测的生信分析

阳德全; 张宁芳; 郑希彦; 王少平

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新型微小RNA-9对乳腺癌增殖的影响及靶基因预测的生信分析

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目的:通过对乳腺癌组织测序发现novel-miR-9在癌组织中呈现低表达。深入研究novel-miR-9对乳腺癌的调控机制及其生物学功能理论机制。方法:运用cck-8以及EdU实验检测novel-miR-9对人乳腺癌细胞增殖的影响;应用生物信息学分析预测novel-miR-9靶基因以及与乳腺癌相关基因;用Venny2.1.0绘制韦恩图得到靶基因集合;对靶基因集合进行GO功能注释分析,找出与细胞增殖相关基因;分析其基因在乳腺癌表达量;并对其进行蛋白交互作用,GO功能注释分析和KEGG Pathway分析。结果:novel-miR-9在人乳腺癌细胞呈低表达(P 0.001);抑制乳腺癌细胞增殖能力(P 0.001);通过Venny图以及GO功能注释分析和蛋白交互作用分析找出与细胞增殖相关的26个基因并发现其相互作用关系较复杂;GO分析发现靶基因可能参与细胞增殖、信号接收等生物过程;KEGG Pathway分析发现其靶基因主要富集在PI3K-Akt、Ras、癌症、癌症中的microRNA等信号通路。结论:novel-miR-9调控参与多种重要的生物学过程,为后续研究提供了线索。

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来源
《亚洲外科手术病例研究》 |2021年第2期|P.13-22|共10页
作者
阳德全; 张宁芳; 郑希彦; 王少平;
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作者单位

中山大学附属第八医院肝胆外科深圳;

中山大学附属第八医院肝胆外科深圳;

中山大学附属第八医院肝胆外科深圳;

中山大学附属第八医院肝胆外科深圳;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类肿瘤学;
关键词
novel-miR-9; 细胞增殖; 靶基因预测; 信号通路; 生物信息学分析;

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