最短尾短体线虫转录组及潜在效应蛋白分析

扈丽丽; 林柏荣; 王宏洪; 陈建松; 廖金铃; 卓侃

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最短尾短体线虫转录组及潜在效应蛋白分析

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最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus)是一种重要的迁移性内寄生植物病原线虫。对其转录组进行测序和分析,是进一步研究其寄生特点和致病机理的重要基础。通过转录组测序和分析,得到72516个unigenes,其中38266个(52.76%)unigenes注释到7个蛋白质数据库中。Cazyme分析预测到541条具有植物/真菌细胞壁降解活性的蛋白质序列,分别属于GH5、GH30、GH53、GH28、PL3、GH16、GH18和GH20家族。转录组中有56个蛋白序列与秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的RNAi通路蛋白具有同源性。鉴定到51个与已知植物寄生线虫效应蛋白具有同源性的蛋白序列,检测了9个潜在效应蛋白在抑制植物防卫反应中的作用,其中7个能够抑制由Gpa2/Rbp-1引起的细胞程序性死亡反应。研究结果表明最短尾短体线虫转录组与同属的短体线虫基因分布特点相似,其潜在效应蛋白具有抑制植物防卫反应的特点。

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来源
《生物技术通报》 |2023年第3期|254-266|共13页
作者
扈丽丽; 林柏荣; 王宏洪; 陈建松; 廖金铃; 卓侃;
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作者单位

广东省森林培育与保护利用重点实验室广东省林业科学研究院;

华南农业大学植物线虫研究室;

广东省微生物信号与病害防治重点实验室;

广东生态工程职业学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类动物医学（兽医学）;
关键词
最短尾短体线虫; 转录组; 效应蛋白; 细胞程序性死亡;

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