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油菜miR399生物信息学分析及靶基因功能预测

         

摘要

本试验利用生物信息学方法分析油菜miR399的分子特征及其靶基因功能,以揭示此基因在油菜生长发育及代谢过程中的重要作用。油菜miR399共有22个成员,其成熟序列长度为20~21 nt,含有17个保守位点,具有高度的保守性。22个前体序列分为6个分支,其中Bna-miR a、b、d、f、l、o和q为第Ⅰ分支,Bna-miR c、e、k、m和p为第Ⅱ分支,Bna-miR i为第Ⅲ分支,Bna-miR g和h为第Ⅳ分支,Bna-miR n和r为第Ⅴ分支,Bna-miR j、s、t、u和v为第Ⅵ分支。靶基因分析表明,miR399参与调控油菜DNA修复、生长发育、光反应周期、生物合成、胁迫响应等多种生理生化过程,对油菜的生长发育起到重要作用。

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