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二代测序全面检测结直肠癌患者BRAF基因突变状态

         

摘要

目的探讨采用二代测序技术分析结直肠癌患者BRAF基因突变特征及其与临床特征的关系。方法收集2015年5月至2017年10月首都医科大学附属北京同仁医院收治的结直肠癌患者组织样本共238例,提取患者组织DNA,进行文库构建与目标区域捕获,应用Illumina HiSeq X-Ten平台对捕获样本进行双端测序,对测序数据进行注释后,分析BRAF基因突变特征及其与临床特征的关系。结果 238例结直肠癌患者中,BRAF V600E突变频率为4.62%,BRAF非V600E突变频率为31.09%,共检出45个BRAF基因突变位点,突变频率前10的位点分别为:p. L711I、p. E715*、p. L711H、p. V600E、p. S713T、p. T332P、p.T244S、p.H477Q、p.L711F、p. I714F。结直肠癌患者的年龄、性别、肿瘤部位、临床分期各亚组间BRAF V600E突变与BRAF非V600E突变检出率,差异均无显著性(P>0.05)。结论本研究描绘了中国人群BRAF基因突变谱,发现了大量非V600E位点的突变,为BRAF基因少见突变在结直肠癌治疗与预后的临床应用提供了研究基础。

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