1株NADC30-like重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及遗传变异分析

邓紫艳; 张锋; 董雅琴; 吴发兴; 段纲; 李晓成

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cqvip:为研究山东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行病毒株的遗传变异情况,本研究从山东省威海市某疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)发病猪场采集的猪肺脏组织中分离到1株PRRSV,命名为SDwh,并对其进行了全基因组序列测定、遗传演化分析和重组分析.结果显示:该病毒株在Marc-145细胞上生长良好,可见明显细胞病变;全基因组演化分析和同源性比对分析结果显示,SDwh株与美国病毒株NADC30和中国的NADC30-like位于同一分支;与北美病毒株NADC30的同源性最高,为93.1%;与我国分离的NADC30-like病毒株CHsx1401、JL580的同源性分别为91.1%和88.4%;与北美经典病毒株VR2332、中国HP-PRRSV JXA1和HuN4的同源性均为85.3%;与欧洲型病毒株Lelystad-virus(LV)同源性最低,为60.6%.与VR2332相比,Nsp2氨基酸序列比对结果显示,SDwh株存在NADC30-like病毒株典型的131个不连续氨基酸的缺失,同时在584~585位缺失2个氨基酸;GP5氨基酸序列比对结果显示,SDwh在GP5抗原表位上有氨基酸的突变.全基因组重组分析结果显示,SDwh株是一株重组病毒株,为NADC30与JXA1-P80的重组病毒,潜在的重组位点位于Nsp2中(2066 nt).本研究结果为PRRSV流行株的重组、演化分析和防控提供借鉴意义.

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来源
《中国动物传染病学报》 |2020年第3期|21-28|共8页
作者
邓紫艳; 张锋; 董雅琴; 吴发兴; 段纲; 李晓成;
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作者单位

中国动物卫生与流行病学中心青岛 266032;

云南农业大学动物医学院昆明 650201;

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正文语种 chi
中图分类 S852.659.6;
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒; 分离鉴定; 重组; 演化分析;

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