山羊产羔数全基因组关联分析

兰蓉; 朱兰; 姚新荣; 王鹏; 邵庆勇; 洪琼花

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山羊产羔数全基因组关联分析

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本研究旨在通过对山羊产羔性状的全基因组关联分析(GWAS),寻找和定位与山羊产羔性状密切关联的新基因.以云南黑山羊6个公羊家系的302只山羊为试验材料,用Illumina公司Iselect Goat60k芯片技术进行SNP分型,分型结果利用plink V1.07的线性回归模型对山羊产羔数性状进行全基因组关联分析.研究结果表明:在2号染色体上有2个SNPs位点与山羊产羔数达到5％基因组水平显著相关(P＜1.48E-6),分别位于SLC4A10基因的下游和TBR1基因的上游;5个SNPs位点与山羊产羔数达潜在关联(P＜2.97E-5),分别位于1号染色体SENP7基因上游,21号染色体Hypothetical Protein基因的上游,以及28号染色体WDFY4基因和TMEM26基因的上游、BICC1基因的下游.这些基因可作为山羊产羔数性状的相关候选基因,也可为山羊产羔性状的分子机制研究和今后标记辅助选择的开展提供理论基础及新的研究线索.

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来源
《畜牧兽医学报》 |2015年第4期|549-554|共6页
作者
兰蓉; 朱兰; 姚新荣; 王鹏; 邵庆勇; 洪琼花;
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作者单位

云南省畜牧兽医科学院,昆明650224;

云南省畜牧兽医科学院,昆明650224;

云南省种羊繁育推广中心,寻甸650000;

云南省种羊繁育推广中心,寻甸650000;

云南省畜牧兽医科学院,昆明650224;

云南省畜牧兽医科学院,昆明650224;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类山羊;生物技术遗传育种;
关键词
云南黑山羊; 产羔数; 全基因组关联分析;

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