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公猪7号染色体繁殖性状QTL的精细定位和位置候选基因MEA1的鉴别研究

         

摘要

本研究旨在精细定位公猪7号染色体(SSC7)影响附睾重和血浆睾酮浓度的数量性状位点(QTL),鉴别影响公猪繁殖性状的位置候选基因.以205头白色杜洛克×二花脸资源家系F2公猪群体为研究材料,在初步定位的QTL区间内增加14个SNPs对该群体进行扫描以精细定位QTL.在精细定位QTL区间内筛选雄性增强抗原1(MEA1)为位置候选基因,采用标准关联分析和F-drop检验分析该基因的多态位点与公猪繁殖性状的关联性,通过实时定量PCR(RT-PCR)和差异表达分析其表达情况.结果表明:①影响附睾重和血浆睾酮浓度的QTL置信区间显著缩小.②MEA1基因的5个SNPs与公猪附睾重、血浆睾酮浓度和射精量极显著或显著相关(P<0.01或P<0.05);单倍型与表型关联性分析显示,G-C-C-G-C单倍型与左、右侧附睾重极显著相关(P<0.01),A-C-C-G-G单倍型与左、右侧附睾重显著相关(P<0.05);F-drop分析显示,g.-1168 A>G和g.1115 A>G位点可能为影响公猪血浆睾酮浓度的主效突变位点(QTN)或与QTN紧密连锁;差异表达分析表明,附睾重与MEA1在附睾中的表达量成负相关(相关系数为-0.300,P=0.1);MEA1在成年公猪的18种组织中均有表达.本研究通过精细定位缩小了7号染色体影响公猪附睾重和血浆睾酮浓度的QTL置信区间;同时发现MEA1基因与公猪附睾重、血浆睾酮浓度和射精量显著相关,其中g.-1168 A>G和g.1115 A>G位点可能是影响公猪血浆睾酮浓度的QTN或与QTN紧密连锁,这2个位点可作为选育性欲较强公猪的分子标记.

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