• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 中文期刊> 《畜牧兽医学报》 >不同来源大白猪总产仔数近交衰退评估

不同来源大白猪总产仔数近交衰退评估

         
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

旨在评估两个不同来源大白猪群体经过近8个世代的选育后总产仔数(total number of piglets born,TNB)近交衰退的程度.本研究对1 937头大白猪使用GeneSeek GGP Porcine HD芯片进行分型,其中1 039头来自加系大白猪和898头来自法系大白猪,且两品系均有表型记录和系谱记录,系谱共由3 086头大白猪组成.分别使用系谱、SNP和ROH进行个体近交系数估计,并将近交系数作为协变量利用动物模型对总产仔数进行近交衰退评估.为了精准定位导致总产仔数衰退的基因组片段,又进一步对每条染色体以及显著染色体分段计算近交系数并估计其效应,检测是否能引起总产仔数发生近交衰退现象.对于加系群体,FROH、FGRM和FPED估计的近交系数均值分别为0.124、0.042和0.013,其中FROH和FPED相关最高,相关系数为0.358;对于法系群体,FROH、FGRM和FPED均值分别为0.123、0.052和0.007,其中FROH和FGRM相关最高,相关系数为0.371.利用3种不同计算方法所得近交系数用于估计近交衰退时,加系群体的总产仔数均检测到显著的近交衰退,而且当FROH、FGRM和FPED每增加10％时,总产仔数分别减少0.571、0.341和0.823头;但法系群体仅有FRO H估计的总产仔数检测到显著近交衰退,FROH每增加10％时,总产仔数减少0.690头.为了锁定相关的染色体和基因组区段,首先利用ROH估计每条染色体近交系数并进行近交衰退分析发现,加系群体中检测到第6、7、8和13号染色体产生了显著近的总产仔数交衰退,而法系群体未检测到与近交衰退相关的染色体.然后,又将与加系总产仔数近交衰退显著相关的4条染色体平均分为2、4、6、8个片段进行近交衰退检测,其中平均分成8段后的染色片段的长度范围为15.1～25.8 Mb.在第6、7和8号染色体分别检测到1、2和3个与总产仔数相关的近交衰退染色体片段.这些区域注释到了CUL7、MAPK14和PPARD基因与胎盘发育相关,AREG和EREG基因与卵母细胞成熟有关.本研究利用3种近交系数计算方法对两个不同来源的大白猪总产仔数进行近交衰退评估,在加系大白猪中3种估计方法都能检测到近交衰退的现象,而法系群体中只有FROH才能检测到.而且通过ROH方法进一步确定了能引起加系大白猪总产仔数衰退的4条染色体和6个特定的染色体区段,还注释到了与繁殖相关的候选基因.这为揭示近交衰退的遗传机制提供了新的研究手段,也为基因组选种选配提供了参考依据.

著录项

  • 来源
    《畜牧兽医学报》 |2021年第10期|2772-2782|共11页
  • 作者

    史良玉; 王立刚; 张鹏飞; 莫家远; 李洋; 王立贤; 赵福平;

  • 作者单位

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

    中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 北京100193;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S828.2;
  • 关键词

    大白猪; 总产仔数; 连续纯合片段; 近交系数; 近交衰退;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号