云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织转录组水平的比较分析

任宇; 丁玥竹; 农燕鸿; 郭爱伟; 刘莉莉

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云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织转录组水平的比较分析

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旨在利用RNA-seq技术筛选和分析云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织的差异表达基因,为独龙鸡后续基因功能、品种改良和种质特性等研究奠定基础。本研究采集了3只43周龄健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与相似饲养条件和周龄的白来航鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与白来航鸡相比,独龙鸡中共有1273个差异表达基因,其中上调基因522个,下调基因751个。GO和KEGG富集分析显示,差异表达基因主要参与蛋白水解、翻译、细胞外泌体、膜组分、结合和催化等过程,在蛋白合成、ECM-受体相互作用、氧化磷酸化、粘着斑等通路中起到重要作用。对显著性通路分析发现独龙鸡在蛋品质和免疫抗性上具有一定优势,但在产蛋性能上与白来航鸡还存在一定差距。本研究筛选到的RPL22、ATP5I、COX5A、JAKMIP1、CATH2基因主要富集在抗性、产蛋性能和蛋品质相关通路中,可作为重要候选基因进一步深入研究。

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来源
《畜牧兽医学报》 |2022年第1期|43-52|共10页
作者
任宇; 丁玥竹; 农燕鸿; 郭爱伟; 刘莉莉;
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作者单位

西南林业大学生命科学学院;

昆明650224;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类遗传、育种;
关键词
独龙鸡; 白来航鸡; 卵巢组织; 转录组测序; 差异表达基因;

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